More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1453 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1453  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 
289 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0659513  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1636  phosphomethylpyrimidine kinase  63.44 
 
 
499 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431333  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2146  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  56.38 
 
 
518 aa  294  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000135123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2392  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  56.58 
 
 
531 aa  290  2e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0171536  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1288  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  56.74 
 
 
494 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0371148  normal  0.427861 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27340  multifunctional hydroxymethylpyrimidine phosphokinase/4-amino-5-aminomethyl-2-methylpyrimidine hydrolase  51.48 
 
 
599 aa  226  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1159  phosphomethylpyrimidine kinase  47.04 
 
 
306 aa  219  3e-56  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675994 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  47.83 
 
 
268 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  47.5 
 
 
285 aa  212  7e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07930  bifunctional enzyme, hydroxymethylpyrimidine kinase / phosphomethylpyrimidine kinase  50.35 
 
 
279 aa  211  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0236651  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  45.29 
 
 
264 aa  208  1e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  50 
 
 
267 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 
266 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.190737 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  45.82 
 
 
265 aa  202  6e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  201  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  201  8e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  201  8e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  201  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  201  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  43.84 
 
 
266 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  44.93 
 
 
266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  46.29 
 
 
285 aa  199  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  40.66 
 
 
267 aa  200  3e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  44.93 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  44.93 
 
 
266 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  44.93 
 
 
266 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  45.29 
 
 
266 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 
269 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  50.54 
 
 
267 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
266 aa  194  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  45.68 
 
 
270 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2300  phosphomethylpyrimidine kinase  50.54 
 
 
267 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  43.93 
 
 
271 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  44.4 
 
 
266 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  43.01 
 
 
266 aa  192  6e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 
266 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  43.84 
 
 
266 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 
269 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 
273 aa  189  5.999999999999999e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  44.68 
 
 
270 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  44.9 
 
 
277 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1183  phosphomethylpyrimidine kinase  45.68 
 
 
518 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00808749  hitchhiker  0.00513051 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  45.05 
 
 
288 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1191  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 
267 aa  185  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  44.24 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  42.55 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  44.29 
 
 
297 aa  182  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 
288 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 
288 aa  182  7e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  42.24 
 
 
267 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.88 
 
 
267 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5051  phosphomethylpyrimidine kinase  49.28 
 
 
274 aa  181  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1361  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 
268 aa  179  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1305  phosphomethylpyrimidine kinase  47.16 
 
 
323 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.279698  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  42.5 
 
 
267 aa  178  7e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1561  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 
335 aa  178  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  42.65 
 
 
271 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  38.91 
 
 
267 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0641  phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 
270 aa  176  4e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.328033  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  42.21 
 
 
277 aa  176  4e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1100  phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 
270 aa  176  5e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0060  phosphomethylpyrimidine kinase  46.43 
 
 
335 aa  175  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.422645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  37.23 
 
 
270 aa  175  9e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1473  phosphomethylpyrimidine kinase  46.43 
 
 
336 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.021769  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1225  phosphomethylpyrimidine kinase  37.1 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  43.37 
 
 
264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1658  phosphomethylpyrimidine kinase  45.65 
 
 
268 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
269 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.74 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
269 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0969  phosphomethylpyrimidine kinase  37.32 
 
 
263 aa  171  9e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.922433  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06838  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
295 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1617  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 
272 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  47.46 
 
 
269 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 
268 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  39.21 
 
 
265 aa  171  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1942  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
269 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  46.74 
 
 
269 aa  169  6e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2073  phosphomethylpyrimidine kinase  47.1 
 
 
269 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  41.09 
 
 
268 aa  169  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000863  phosphomethylpyrimidine kinase  38.93 
 
 
286 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4493  phosphomethylpyrimidine kinase  42.91 
 
 
266 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2479  phosphomethylpyrimidine kinase  44.2 
 
 
268 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0351011  hitchhiker  0.000627669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
268 aa  167  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 
271 aa  167  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0854  phosphomethylpyrimidine kinase  45.96 
 
 
279 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0599289  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  41.45 
 
 
267 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10848  probable phosphomethylpyrimidine kinase (ThiD)  36.07 
 
 
269 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0191434  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  40.73 
 
 
268 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0486  phosphomethylpyrimidine kinase  40 
 
 
284 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  41.79 
 
 
497 aa  166  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  36.69 
 
 
267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  43.48 
 
 
490 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  45.99 
 
 
287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1124  phosphomethylpyrimidine kinase  34.04 
 
 
270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  41.99 
 
 
268 aa  165  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1498  phosphomethylpyrimidine kinase  35.4 
 
 
257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.315358  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  34.18 
 
 
264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>