More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0477 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0477  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  100 
 
 		 300 aa  607  1e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.376416  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0547  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  77.07 
 
 		 226 aa  335  5.999999999999999e-91  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.481769 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07460  NADH dehydrogenase subunit I  76.7 
 
 		 252 aa  331  8e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0206751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3221  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  78.06 
 
 		 254 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2708  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  74.88 
 
 		 247 aa  318  5e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0528  NADH dehydrogenase subunit I  67.05 
 
 		 196 aa  247  2e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13174  NADH dehydrogenase subunit I  69.4 
 
 		 218 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4489  NADH dehydrogenase subunit I  68.75 
 
 		 175 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.159742 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0546  NADH dehydrogenase subunit I  60.61 
 
 		 217 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175795  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0394  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  66.47 
 
 		 175 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7683  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  62.57 
 
 		 203 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1877  NADH dehydrogenase subunit I  67.06 
 
 		 174 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1542  NADH dehydrogenase subunit I  65.17 
 
 		 174 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.383544  normal  0.0726132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1572  NADH dehydrogenase subunit I  65.17 
 
 		 174 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1596  NADH dehydrogenase subunit I  65.17 
 
 		 174 aa  235  8e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6086  NADH dehydrogenase subunit I  63.84 
 
 		 211 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00224994  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0275  NADH dehydrogenase subunit I  69.01 
 
 		 199 aa  233  3e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0289  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.88 
 
 		 171 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2687  NADH dehydrogenase subunit I  64.5 
 
 		 183 aa  227  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0721276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5061  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.66 
 
 		 185 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.451376  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3176  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  67.05 
 
 		 167 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4410  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  65.09 
 
 		 194 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0592  Formate hydrogenlyase subunit 6/NADH:ubiquinone oxidoreductase 23 kD subunit (chain I)-like protein  63.91 
 
 		 171 aa  225  6e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6674  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 		 188 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1282  NADH-quinone oxidoreductase chain I  58.14 
 
 		 185 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.425102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03240  NADH dehydrogenase subunit I  62.42 
 
 		 187 aa  215  5.9999999999999996e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4455  NADH dehydrogenase subunit I  58.86 
 
 		 211 aa  215  7e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.829117  normal  0.833546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4057  NADH dehydrogenase subunit I  58.86 
 
 		 211 aa  215  7e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.819652  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4550  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  63.64 
 
 		 211 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0982  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  62.42 
 
 		 214 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0371  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  57.04 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.839117  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2235  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.68 
 
 		 165 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0917  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  53.33 
 
 		 179 aa  147  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.5865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1869  NADH-quinone oxidoreductase chain I  53.19 
 
 		 177 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3387  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  49.68 
 
 		 165 aa  146  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.533197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1275  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  48.97 
 
 		 199 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1157  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  50.35 
 
 		 177 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1845  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  43.42 
 
 		 175 aa  135  8e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3216  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  44.94 
 
 		 168 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3336  NADH dehydrogenase subunit I  44.06 
 
 		 162 aa  117  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.463064  normal  0.437664 
 
 
-
 
NC_002978  WD0980  NADH dehydrogenase subunit I  41.61 
 
 		 169 aa  116  3.9999999999999997e-25  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0211  NADH dehydrogenase subunit I  46.27 
 
 		 176 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1041  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  52.45 
 
 		 165 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3372  NADH dehydrogenase I, I subunit  43.75 
 
 		 182 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.675448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3204  NADH dehydrogenase subunit I  43.75 
 
 		 182 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0843328  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3610  NADH dehydrogenase subunit I  43.94 
 
 		 182 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.487333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3434  NADH dehydrogenase subunit I  42.76 
 
 		 176 aa  112  6e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.460482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0163  NADH dehydrogenase subunit I  40.69 
 
 		 184 aa  112  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4126  NADH dehydrogenase subunit I  43.06 
 
 		 182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1739  NADH dehydrogenase subunit I  43.06 
 
 		 182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.220023 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3698  NADH dehydrogenase subunit I  43.06 
 
 		 182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.380267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1866  NADH dehydrogenase subunit I  43.06 
 
 		 182 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05770  conserved hypothetical protein  40.15 
 
 		 273 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28510  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559317  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0691  NADH dehydrogenase subunit I  36.54 
 
 		 169 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.438917  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7011  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  41.06 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3627  NADH dehydrogenase subunit I  38.56 
 
 		 164 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704772 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0829  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.260339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1043  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 		 163 aa  110  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2562  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 		 182 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4625  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 		 162 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.11536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2212  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 		 162 aa  110  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.199823  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29920  NADH dehydrogenase subunit I  43.18 
 
 		 182 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.546828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1879  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 		 162 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.508831  normal  0.262119 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0361  NADH dehydrogenase subunit I  37.09 
 
 		 167 aa  109  5e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.326031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1563  NADH dehydrogenase subunit I  40.14 
 
 		 162 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.339949  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1692  NADH dehydrogenase subunit I  37.09 
 
 		 182 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2765  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 		 180 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1499  NADH dehydrogenase subunit I  39.58 
 
 		 180 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1743  NADH dehydrogenase subunit I  46.46 
 
 		 164 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00386762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1120  NADH dehydrogenase subunit I  37.5 
 
 		 180 aa  108  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.311189  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0107  NADH dehydrogenase subunit I  46.46 
 
 		 164 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.807538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1020  NADH dehydrogenase subunit I  40.91 
 
 		 171 aa  108  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755319  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1567  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.997394  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2412  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0701412  normal  0.0109704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1461  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  108  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2877  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 		 162 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.670141  normal  0.245456 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2419  NADH dehydrogenase subunit I  44.44 
 
 		 182 aa  108  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3218  NADH dehydrogenase subunit I  40.58 
 
 		 163 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1809  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.693845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2560  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0213368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2549  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2667  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0323  NADH dehydrogenase subunit I  41.55 
 
 		 176 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2292  NADH dehydrogenase subunit I  39.44 
 
 		 161 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3301  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2460  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4134  NADH dehydrogenase subunit I  38.41 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.181277  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3818  NADH-quinone oxidoreductase, chain I  38.3 
 
 		 171 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2505  NADH dehydrogenase subunit I  40.97 
 
 		 180 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02206  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3420  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4553  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 		 162 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.128776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02166  hypothetical protein  40.28 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2657  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2543  NADH dehydrogenase subunit I  38.89 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.879169  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2430  NADH dehydrogenase subunit I  40.28 
 
 		 180 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4398  NADH dehydrogenase subunit I  38.41 
 
 		 162 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2582  NADH dehydrogenase subunit I  39.86 
 
 		 162 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561308  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0172  NADH dehydrogenase subunit I  38.69 
 
 		 176 aa  107  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>