180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4813 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4813  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.394835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0803  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  69.81 
 
 
340 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8798  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  64.15 
 
 
341 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1017  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.05 
 
 
342 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3160  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.05 
 
 
342 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3561  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.05 
 
 
342 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0894579  normal  0.267688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3844  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46.05 
 
 
342 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.464911  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5594  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  56.6 
 
 
340 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3485  hypothetical protein  56.6 
 
 
87 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.145421 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1434  hypothetical protein  50.94 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3450  hypothetical protein  50.94 
 
 
101 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.51037  normal  0.264897 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2401  transposase IS110 family protein  54.72 
 
 
343 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3170  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  54.72 
 
 
348 aa  63.9  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0109  transposase IS116/IS110/IS902  54.72 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250227  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0132  transposase IS116/IS110/IS902  54.72 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.020989  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2306  transposase IS116/IS110/IS902  54.72 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2934  transposase IS116/IS110/IS902  54.72 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3007  transposase IS116/IS110/IS902  54.72 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.107293  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3682  transposase IS116/IS110/IS902  54.72 
 
 
343 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1959  transposase IS116/IS110/IS902  52.83 
 
 
343 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3955  transposase IS116/IS110/IS902  58.49 
 
 
342 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0808  transposase IS116/IS110/IS902  56.6 
 
 
342 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.586145  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3936  transposase IS116/IS110/IS902  50.94 
 
 
343 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3939  transposase IS116/IS110/IS902  52.83 
 
 
341 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3118  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  47.17 
 
 
338 aa  58.5  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0742  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
350 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8455  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  60 
 
 
333 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0804  transposase, IS111A/IS1328/IS1533  46 
 
 
181 aa  57.4  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796908  hitchhiker  0.00222246 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5032  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
338 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0181  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0473  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.214803  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6905  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6016  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
350 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0904  IS110 family transposase  41.18 
 
 
341 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2286  IS110 family transposase  41.18 
 
 
341 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  hitchhiker  0.00653664 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4518  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
337 aa  53.9  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6452  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.14 
 
 
340 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.147811  normal  0.356209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3079  transposase IS116/IS110/IS902  45.28 
 
 
337 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3085  transposase IS116/IS110/IS902  45.28 
 
 
337 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4608  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.14 
 
 
346 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5872  transposase IS116/IS110/IS902  43.4 
 
 
341 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0505  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
341 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0567  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
341 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0767  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
341 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2205  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
341 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2966  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.4 
 
 
341 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220936  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2066  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.1 
 
 
343 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.819245  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2037  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  45.1 
 
 
343 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.437625  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4841  hypothetical protein  43.14 
 
 
265 aa  50.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.160806 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45790  Transposase IS116/IS110/IS902  48.94 
 
 
338 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.997681  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30230  Transposase IS116/IS110/IS902  48.94 
 
 
338 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44660  Transposase IS116/IS110/IS902  48.94 
 
 
338 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35590  Transposase IS116/IS110/IS902  48.94 
 
 
338 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13560  Transposase IS116/IS110/IS902  48.94 
 
 
338 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.682801  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09560  transposase IS116/IS110/IS902  48.94 
 
 
338 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.927637  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4287  hypothetical protein  63.89 
 
 
52 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0993  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46 
 
 
341 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0995  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  46 
 
 
341 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.566106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1280  rmpB-like protein  39.62 
 
 
303 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.251408  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3701  hypothetical protein  48.94 
 
 
348 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.921253 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0735  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  48.94 
 
 
348 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07105  hypothetical protein  41.51 
 
 
391 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3943  transposase IS116/IS110/IS902  41.51 
 
 
338 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4362  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.22 
 
 
347 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4532  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
499 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3359  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
342 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6580  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.22 
 
 
341 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0128065  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18390  Transposase IS116/IS110/IS902 family  43.14 
 
 
341 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0427  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.674473  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1396  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.199671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1747  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  37.25 
 
 
346 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.279205  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0802  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  50.94 
 
 
338 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.890178 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7300  transposase  62.86 
 
 
341 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.19933  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09760  Transposase, IS111A/IS1328/IS1533  41.51 
 
 
346 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7698  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  44 
 
 
342 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.951148  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02591  hypothetical protein  43.4 
 
 
355 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2714  hypothetical protein  44 
 
 
342 aa  48.1  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8105  IS1111A/IS1328/IS1533 family transposase  46.81 
 
 
298 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.162674  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0504  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
337 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0754  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
337 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0914  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
337 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.694774 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3024  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  41.18 
 
 
337 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.923031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2519  transposase  41.18 
 
 
209 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0829328  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0399  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.14 
 
 
347 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2644  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.14 
 
 
347 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0103758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3770  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  43.14 
 
 
347 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0590738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2571  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  39.62 
 
 
346 aa  47  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01475  hypothetical protein  43.4 
 
 
338 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08193  transposase  43.4 
 
 
338 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02812  hypothetical protein  43.4 
 
 
338 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05053  hypothetical protein  43.4 
 
 
338 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0199  transposase IS116/IS110/IS902  45.1 
 
 
347 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3311  transposase IS116/IS110/IS902  45.1 
 
 
347 aa  47  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.675439  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3816  transposase IS116/IS110/IS902  35.85 
 
 
340 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.531906  normal  0.5614 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2806  transposase IS116/IS110/IS902  45.1 
 
 
337 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3360  transposase IS116/IS110/IS902  45.1 
 
 
337 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3404  transposase  45.1 
 
 
141 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3083  transposase IS116/IS110/IS902  45.1 
 
 
343 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0426  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.59 
 
 
355 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.509366  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1395  transposase IS116/IS110/IS902 family protein  42.59 
 
 
355 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.688347  normal  0.139029 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>