More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4685 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4685  virulence factor MVIN family protein  100 
 
 
553 aa  1070    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.562732 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1033  integral membrane protein MviN  38.96 
 
 
522 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.105478  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3067  virulence factor MVIN family protein  39.51 
 
 
538 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1882  integral membrane protein MviN  39.33 
 
 
527 aa  259  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2468  integral membrane protein MviN  39.59 
 
 
529 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.135874  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3967  integral membrane protein MviN  34.98 
 
 
540 aa  227  3e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0736  virulence factor MVIN family protein  34.28 
 
 
537 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0997  integral membrane protein MviN  30.91 
 
 
531 aa  176  8e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000225654  hitchhiker  0.00636735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3098  integral membrane protein MviN  31.38 
 
 
523 aa  166  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1584  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 
521 aa  164  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0236223  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4312  integral membrane protein MviN  29.48 
 
 
521 aa  160  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2088  integral membrane protein MviN  34.28 
 
 
526 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.160318  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3425  integral membrane protein MviN  31.74 
 
 
529 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1654  integral membrane protein MviN  31.27 
 
 
521 aa  155  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  31.97 
 
 
524 aa  154  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1051  integral membrane protein MviN  27 
 
 
525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000233092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2176  integral membrane protein MviN  30.72 
 
 
511 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2272  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 
511 aa  141  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1610  integral membrane protein MviN  27.57 
 
 
514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2257  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 
511 aa  137  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2531  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 
511 aa  137  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.415764  normal  0.0831768 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2060  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 
511 aa  137  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.178549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1583  integral membrane protein MviN  27.05 
 
 
511 aa  137  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1192  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 
511 aa  137  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1192  integral membrane protein MviN  30.47 
 
 
511 aa  137  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0703  integral membrane protein MviN  31.2 
 
 
511 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.220129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01065  predicted inner membrane protein  30.21 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2577  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01073  hypothetical protein  30.21 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1448  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
511 aa  137  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00196842 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1282  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.226684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2202  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.582397  hitchhiker  0.00351914 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1238  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.196455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2018  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1267  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
524 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0487336 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2400  virulence factor MVIN-like  26.62 
 
 
521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000204704  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4232  integral membrane protein MviN  27.49 
 
 
522 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0229332  hitchhiker  0.00000767469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0804  membrane protein, MviN family  28.65 
 
 
512 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0938016  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2046  integral membrane protein MviN  26.54 
 
 
511 aa  133  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.234316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0647  integral membrane protein MviN  29.72 
 
 
512 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0843167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4854  virulence factor MVIN-like  30.17 
 
 
512 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.572015  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0479  integral membrane protein MviN  28.44 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2083  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 
511 aa  131  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244759  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0714  integral membrane protein MviN  30.6 
 
 
517 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4561  integral membrane protein MviN  29.44 
 
 
512 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.434356  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0559  integral membrane protein MviN  30.6 
 
 
517 aa  131  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0642  integral membrane protein MviN  28.77 
 
 
512 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.180976 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0601  MviN family membrane protein  28.77 
 
 
512 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1806  integral membrane protein MviN  30.21 
 
 
511 aa  130  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0960933  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0712  integral membrane protein MviN  29.2 
 
 
511 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.83297  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0708  virulence factor MVIN-like  27.83 
 
 
528 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.933126  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1235  integral membrane protein MviN  29.41 
 
 
526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0291  integral membrane protein MviN  28.7 
 
 
613 aa  129  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195514  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2158  integral membrane protein MviN  25.65 
 
 
542 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33814  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5202  integral membrane protein MviN  31 
 
 
512 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.869199  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03032  MviN protein  29.1 
 
 
505 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010248  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11760  integral membrane protein MviN  30.34 
 
 
514 aa  127  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717987  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2688  hypothetical protein  27.73 
 
 
523 aa  127  7e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2440  integral membrane protein MviN  26.15 
 
 
511 aa  127  7e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00101371  normal  0.0161102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0860  integral membrane protein MviN  29.3 
 
 
495 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.259397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2490  integral membrane protein MviN  28.1 
 
 
521 aa  125  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2560  hypothetical protein  27.13 
 
 
523 aa  124  6e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2792  integral membrane protein MviN  27.68 
 
 
511 aa  123  8e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.254117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1417  integral membrane protein MviN  27.81 
 
 
526 aa  123  8e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.00326e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0543  integral membrane protein MviN  32.16 
 
 
527 aa  123  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2679  integral membrane protein MviN  30.81 
 
 
512 aa  123  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.939171  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0143  virulence factor MviN  27.2 
 
 
529 aa  123  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1855  virulence factor MVIN-like protein  30.98 
 
 
512 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2191  integral membrane protein MviN  26.65 
 
 
494 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0116874  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60390  putative virulence factor, membrane protein  30.03 
 
 
512 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000610736 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1580  virulence factor  29.87 
 
 
536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.716826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3038  virulence factor MVIN-like  28.1 
 
 
512 aa  121  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00171259  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00013  integral membrane protein MviN  30.08 
 
 
524 aa  121  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2245  integral membrane protein MviN  27.73 
 
 
521 aa  121  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1470  integral membrane protein MviN  27.37 
 
 
523 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0951  integral membrane protein MviN  29.71 
 
 
513 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.979751  normal  0.521611 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0502  integral membrane protein MviN  27.67 
 
 
515 aa  120  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1123  integral membrane protein MviN  28.36 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.483534  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2327  integral membrane protein MviN  27.04 
 
 
528 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0277  integral membrane protein MviN  29.19 
 
 
508 aa  119  9.999999999999999e-26  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0137  integral membrane protein MviN  26.47 
 
 
555 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.381572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1523  integral membrane protein MviN  29.61 
 
 
536 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1036  integral membrane protein MviN  31.45 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2210  integral membrane protein MviN  29.3 
 
 
513 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0907  integral membrane protein MviN  27.34 
 
 
522 aa  117  5e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3399500000000005e-32 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0044  integral membrane protein MviN  28.37 
 
 
526 aa  117  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3225  integral membrane protein MviN  28.01 
 
 
517 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.104496  normal  0.394976 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0675  integral membrane protein MviN  26.99 
 
 
549 aa  117  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.136729  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1097  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 
519 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000276911  normal  0.0876862 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0029  integral membrane protein MviN  29.02 
 
 
528 aa  117  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286969  normal  0.951937 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1676  virulence factor  27.55 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3214  integral membrane protein MviN  27.66 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0156  integral membrane protein MviN  26.92 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.365768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2558  integral membrane protein MviN  27.79 
 
 
522 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.900363  normal  0.0167676 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1607  integral membrane protein MviN  25.83 
 
 
469 aa  115  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.916233  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1757  integral membrane protein MviN  27.85 
 
 
517 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3261  integral membrane protein MviN  25.8 
 
 
522 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.118117  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0708  virulence factor MVIN-like  31.1 
 
 
516 aa  114  6e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0617008 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0132  integral membrane protein MviN  29.67 
 
 
528 aa  113  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1010  integral membrane protein MviN  25 
 
 
495 aa  113  9e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0666785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>