165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3461 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3461  extracellular solute-binding protein  100 
 
 
285 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.564747  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4884  extracellular solute-binding protein family 3  49.28 
 
 
266 aa  224  9e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  32.93 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5170  ABC transporter substrate binding protein (amino acid)  27.42 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1889  extracellular solute-binding protein family 3  30.32 
 
 
268 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.22 
 
 
280 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0117  extracellular solute-binding protein  27.32 
 
 
272 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5765  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 
286 aa  68.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000625971 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.47 
 
 
305 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3310  extracellular solute-binding protein  24.49 
 
 
280 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1898  extracellular solute-binding protein family 3  29.3 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5767  extracellular solute-binding protein  25.57 
 
 
272 aa  62.4  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000244611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2397  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21410  ABC transporter, substrate binding protein, family 3  24.02 
 
 
292 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.334752  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1129  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.69 
 
 
283 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2434  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.27 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5520  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 
281 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222381  normal  0.174811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44520  extracellular solute-binding protein  31.03 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.541639  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5766  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 
308 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000645831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  23.64 
 
 
281 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  24.37 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2512  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.57 
 
 
264 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.226859  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8012  extracellular solute-binding protein family 3  23.08 
 
 
281 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1051  extracellular solute-binding protein family 3  19.9 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1254  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1737  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.084035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0395  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1808  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.655664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1824  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0726824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0767  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
264 aa  52.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0133342  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3711  extracellular solute-binding protein  23.25 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1977  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26.32 
 
 
284 aa  52.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1868  extracellular solute-binding protein family 3  19.8 
 
 
247 aa  52.4  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.265180000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.78 
 
 
264 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1232  arginine-binding periplasmic protein 1  23.02 
 
 
242 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2916  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.07 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0769727 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1233  CjaC  23.19 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1298  glutamine ABC transporter periplasmic protein  25.25 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.219686  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3278  extracellular solute-binding protein  29.2 
 
 
276 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.806697  normal  0.241519 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1652  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  23.15 
 
 
244 aa  51.2  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.513751 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1452  amino acid ABC transporter periplasmic protein  24.14 
 
 
264 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000020347  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  25.39 
 
 
264 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0632  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.22 
 
 
257 aa  49.7  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0329945  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  21.97 
 
 
277 aa  50.1  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1448  extracellular solute-binding protein  22.27 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.194926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  20.2 
 
 
257 aa  49.7  0.00006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1679  extracellular solute-binding protein  24.78 
 
 
264 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0815907 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1562  extracellular solute-binding protein  22.13 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.470134  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24 
 
 
269 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0991  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.06 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2064  lysine-arginine-ornithine-binding periplasmic protein  23.36 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0959  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.06 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1022  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.06 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0924  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.06 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0338236  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1041  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtJ  22.06 
 
 
243 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.385191  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00778  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2488  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.75 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.405859  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2831  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0546212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2022  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  23.56 
 
 
748 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5481  extracellular solute-binding protein  24.23 
 
 
270 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0366  extracellular solute-binding protein  21.08 
 
 
253 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0960  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000163371  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0835  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000431676  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1376  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  20.9 
 
 
243 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0594  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.22 
 
 
257 aa  47.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1846  extracellular solute-binding protein  30.3 
 
 
277 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.898841  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
258 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0867  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0880  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000245333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  22.32 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1135  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0567537  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00795  hypothetical protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2832  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.220182  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0208  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  18.78 
 
 
257 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0259  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  18.78 
 
 
257 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000559258 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3131  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0249016 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  23.13 
 
 
344 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2537  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.24 
 
 
248 aa  47  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000279663  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2507  cystine transporter subunit  26.04 
 
 
266 aa  47.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.292922  normal  0.810962 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2639  arginine ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein ArtJ  21.18 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000964568  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2471  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  21.39 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.198291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1479  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.5 
 
 
247 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1569  arginine ABC transporter periplasmic substrate-binding protein ArtJ  21.18 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2724  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.18 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00108182  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1549  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.91 
 
 
266 aa  46.6  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.356902  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1454  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
264 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0888  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtJ  20.9 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214233  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0495  TcmP  23.68 
 
 
255 aa  47  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0925  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.5 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0376492  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0866  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.74 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.717155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0894  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.74 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1529  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1073  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1553  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
264 aa  46.6  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0978  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.74 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0375425  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0957  glutamine ABC transporter periplasmic protein  23.74 
 
 
248 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0849319  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52790  arginine/ornithine binding protein AotJ  23.17 
 
 
259 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  24.7 
 
 
493 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0012  extracellular solute-binding protein family 3  24.06 
 
 
275 aa  46.2  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1773  glutamine ABC transporter periplasmic protein  24.1 
 
 
247 aa  46.2  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000148695  normal  0.114873 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>