More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2150 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_2150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
268 aa  521  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0939917  normal  0.176342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4044  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  70.47 
 
 
261 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0830657  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5852  molybdenum ABC transporter permease  69.35 
 
 
261 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.581419  normal  0.526214 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1665  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.87 
 
 
261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1271  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.63 
 
 
261 aa  337  8e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104135  normal  0.640499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4842  putative ABC transporter inner membrane protein  66.67 
 
 
291 aa  333  2e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.860771  normal  0.0587965 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.94 
 
 
300 aa  322  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760179  normal  0.495505 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3314  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.6 
 
 
262 aa  319  3e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147455  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1466  ABC polyamine transporter, inner membrane subunit  64.94 
 
 
300 aa  318  7e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0507128  normal  0.124115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1503  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.64 
 
 
312 aa  315  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.282781  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.49 
 
 
298 aa  312  2.9999999999999996e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731426  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.31 
 
 
298 aa  298  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.11 
 
 
265 aa  292  4e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420576  normal  0.120136 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.7 
 
 
265 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1793  ABC transporter permease  65.56 
 
 
265 aa  290  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.849444  normal  0.0352963 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.89 
 
 
298 aa  288  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2833  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
410 aa  287  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0920075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1415  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
366 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146328  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0497  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
362 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1211  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
362 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197633  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0656  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
362 aa  286  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1408  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.907459  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1541  ABC transporter, permease protein  64.96 
 
 
347 aa  285  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4341  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  63.1 
 
 
298 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.801561  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.26 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177447  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0751  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.26 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1232  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.26 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.162755  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0488  ABC transporter, permease protein  63.64 
 
 
264 aa  271  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4693  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  63.2 
 
 
264 aa  270  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3075  ABC transporter, permease protein  65.81 
 
 
243 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.43 
 
 
265 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.840186 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.57 
 
 
266 aa  251  6e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.66 
 
 
294 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00110867  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
272 aa  107  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.210545  normal  0.706839 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2374  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
304 aa  106  5e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0446  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
282 aa  97.4  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1822  putative ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131569  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1111  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2084  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.217938  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0820  ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 
282 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0352  ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
282 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.734925  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1784  putative ABC transport system, membrane protein  33.69 
 
 
282 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1647  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
262 aa  95.5  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0387101  normal  0.554966 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
259 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1527  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 
266 aa  92.4  7e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00122012 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0385  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 
266 aa  92  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1923  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
262 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.438917 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1445  NifC-like ABC-type porter  33.33 
 
 
266 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.452382  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4199  ABC spermidine/putrescine transporter, innermembrane subunit  36.42 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.853944  normal  0.687216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.613634  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0516  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037786  normal  0.544332 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.84 
 
 
267 aa  89.4  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  29.96 
 
 
256 aa  89  8e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2420  putative ABC spermidine/putrescine transporter permease protein  36.41 
 
 
281 aa  88.6  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.814446  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  28.29 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2473  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
261 aa  88.2  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  31.25 
 
 
260 aa  88.2  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6717  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  36.71 
 
 
280 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00799546  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  29.11 
 
 
256 aa  87  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2178  ABC transporter membrane spanning protein  35.55 
 
 
288 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178146  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
263 aa  86.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.512625  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
254 aa  85.9  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.943674  normal  0.650517 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5488  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
315 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.154787  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  27.49 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5372  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.49 
 
 
266 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0808  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
230 aa  82.8  0.000000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.65252  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8149  ABC transporter  33.18 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.828592  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6272  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
280 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.596153  normal  0.412675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.55 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.420335  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  27.09 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  27.09 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  27.09 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  27.09 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  27.09 
 
 
266 aa  82  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.48 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1236  ABC spermidine/putrescine transporter, inner membrane subunit  32.33 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362839  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.91 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475602  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.74 
 
 
260 aa  80.9  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0084  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.77 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395984  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1184  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  29.73 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.548615  hitchhiker  0.000438991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2950  ABC transporter  31.55 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.507448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  32.06 
 
 
293 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4689  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
276 aa  79.3  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.36 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.467922  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2859  molybdate ABC transporter permease  30.63 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371586  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
295 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102355  normal  0.118273 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1618  NifC-like ABC-type porter  30 
 
 
266 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156172  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
262 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.52 
 
 
264 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.623194  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.44 
 
 
213 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.139435  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>