More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1266 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  100 
 
 		 249 aa  488  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  63.02 
 
 		 292 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1081  ribonuclease HII  61.65 
 
 		 284 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.995497  normal  0.476775 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  57.4 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  64.06 
 
 		 266 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1208  ribonuclease HII  65.8 
 
 		 298 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.621532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  61.14 
 
 		 267 aa  208  5e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  55.45 
 
 		 279 aa  207  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1226  ribonuclease HII  63.02 
 
 		 281 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  53.54 
 
 		 229 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  55.56 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  52.5 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  56.63 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  52.53 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  56.04 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  50.45 
 
 		 248 aa  191  9e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  55.1 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  55.1 
 
 		 212 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  53.54 
 
 		 210 aa  189  5e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  53.54 
 
 		 217 aa  189  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  59.22 
 
 		 235 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  53.54 
 
 		 217 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  50.95 
 
 		 214 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  54.59 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  60.34 
 
 		 209 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  50.93 
 
 		 249 aa  186  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  55.92 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  55.92 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  60.22 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  55.92 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  55.92 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  50.48 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  55.92 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  50.48 
 
 		 214 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  60.34 
 
 		 209 aa  185  7e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  60.34 
 
 		 209 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  55.92 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  55.45 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  52.28 
 
 		 214 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  59.22 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2613  ribonuclease HII  55.85 
 
 		 240 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 208 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  49.74 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  51.23 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  52.78 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  56.35 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  51.72 
 
 		 214 aa  178  7e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  53.2 
 
 		 213 aa  178  8e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  54.59 
 
 		 212 aa  178  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  54.04 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  55.31 
 
 		 198 aa  177  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  55.8 
 
 		 199 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  47.94 
 
 		 198 aa  176  3e-43  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  50.72 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  53.03 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  51.32 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  55.56 
 
 		 218 aa  174  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 208 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1292  ribonuclease HII  54.17 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.060784  normal  0.581124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1356  ribonuclease HII  53.65 
 
 		 232 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  53.81 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  53.03 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  46.91 
 
 		 277 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50 
 
 		 199 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3884  ribonuclease HII  51.04 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3879  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000611644  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  53.37 
 
 		 224 aa  169  6e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  52.88 
 
 		 202 aa  168  7e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.94 
 
 		 211 aa  168  7e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  54.1 
 
 		 198 aa  168  8e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3850  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3578  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000296428  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2002  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  51.34 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  52.02 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3688  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0486132  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3596  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00191298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  52.91 
 
 		 202 aa  167  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3975  ribonuclease HII  50 
 
 		 257 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000780116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 212 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  52.53 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  51.61 
 
 		 198 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  50 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1867  ribonuclease HII  49.77 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0144978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2192  RNase HII  55 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  52.26 
 
 		 207 aa  165  8e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  165  8e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 214 aa  164  9e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  51.08 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  51.26 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  52.22 
 
 		 197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  49.24 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>