More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3416 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  78.39 
 
 
322 aa  498  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  58.06 
 
 
320 aa  367  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  55.56 
 
 
313 aa  345  6e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  54.19 
 
 
315 aa  333  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  54.22 
 
 
313 aa  318  6e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  52.75 
 
 
349 aa  318  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  51.46 
 
 
313 aa  308  6.999999999999999e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  49.2 
 
 
318 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  48.05 
 
 
318 aa  296  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  49.67 
 
 
325 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  50 
 
 
325 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  43.23 
 
 
310 aa  275  9e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  44.16 
 
 
314 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  47.27 
 
 
317 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  48.69 
 
 
326 aa  259  6e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  45.16 
 
 
319 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  45.48 
 
 
318 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  45.66 
 
 
318 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  44.84 
 
 
319 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  44.84 
 
 
319 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  44.84 
 
 
318 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  44.84 
 
 
318 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  44.84 
 
 
318 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  41.31 
 
 
299 aa  233  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  44.48 
 
 
323 aa  229  4e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  45.02 
 
 
318 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  45.02 
 
 
318 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  44.69 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  44.69 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  44.69 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  44.69 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  44.69 
 
 
318 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 
320 aa  203  4e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  42.42 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.25 
 
 
326 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 
322 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.95 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.39 
 
 
323 aa  117  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 
317 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.2 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.68 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 
308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.2 
 
 
308 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
308 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.03 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.22 
 
 
322 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  28.94 
 
 
323 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.41 
 
 
308 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.41 
 
 
308 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.85 
 
 
315 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  29.15 
 
 
333 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  27.53 
 
 
315 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  29.77 
 
 
312 aa  106  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  32.85 
 
 
308 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  30.69 
 
 
309 aa  106  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.66 
 
 
298 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 
319 aa  105  8e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.05 
 
 
316 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  31.65 
 
 
311 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
301 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.1 
 
 
323 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.15 
 
 
333 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 
312 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  29.39 
 
 
313 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.65 
 
 
308 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  31.6 
 
 
311 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  29.39 
 
 
313 aa  102  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.41 
 
 
309 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 
319 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  29.01 
 
 
319 aa  102  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 
301 aa  101  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29 
 
 
317 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.43 
 
 
307 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.81 
 
 
337 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.88 
 
 
315 aa  99.8  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.97 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  29.72 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.38 
 
 
306 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  28.8 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  27.3 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.21 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.21 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.21 
 
 
313 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.48 
 
 
315 aa  98.2  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.07 
 
 
304 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.07 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  30.94 
 
 
316 aa  96.3  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  28.03 
 
 
313 aa  95.9  8e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.25 
 
 
319 aa  95.5  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  32.85 
 
 
308 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  32.85 
 
 
308 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  32.38 
 
 
314 aa  95.5  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  32.85 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  29.55 
 
 
323 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  29.85 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.35 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>