More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2015 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2015  ABC transporter related  100 
 
 		 395 aa  791    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.432172 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2160  ABC transporter related  50.25 
 
 		 374 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.091437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3229  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.65 
 
 		 369 aa  345  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.301475  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2570  ABC transporter related  50.38 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2492  ABC transporter related protein  45.76 
 
 		 370 aa  302  9e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.469403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03330  ABC transporter related  40.87 
 
 		 378 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  37.56 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0287  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 371 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0901665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1816  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 390 aa  275  7e-73  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5438  ABC transporter related protein  42.52 
 
 		 369 aa  275  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  39.13 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  38.85 
 
 		 370 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  38.78 
 
 		 367 aa  271  1e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  40 
 
 		 357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 380 aa  270  2.9999999999999997e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1862  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 370 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  40.87 
 
 		 356 aa  269  5.9999999999999995e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  40.62 
 
 		 357 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2909  ABC transporter related  37.63 
 
 		 372 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  38.17 
 
 		 402 aa  267  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4866  ABC transporter related  39.07 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.112341 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  37.85 
 
 		 369 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1878  ABC transporter related  42.24 
 
 		 371 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229415  normal  0.103205 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  37.5 
 
 		 367 aa  266  7e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  37.5 
 
 		 367 aa  266  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2598  ABC transporter related  40.47 
 
 		 375 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.375786  normal  0.576276 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0973  ABC transporter related protein  37.34 
 
 		 364 aa  265  1e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  36.48 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  36.55 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  41.28 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4498  ABC transporter related protein  38.48 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0512744  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  39.48 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  40.21 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  40.21 
 
 		 375 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  37.85 
 
 		 367 aa  262  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1821  ABC transporter related  39.29 
 
 		 382 aa  262  6.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3666  ABC transporter related  40.41 
 
 		 365 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4055  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 364 aa  261  1e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  39.65 
 
 		 370 aa  261  1e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2324  ABC transporter related protein  51.69 
 
 		 409 aa  261  2e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0104165  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2139  ABC transporter related  37.34 
 
 		 384 aa  261  2e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.724946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1804  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 360 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.438286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2935  ABC transporter related protein  44.16 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0525  ABC transporter related  40.51 
 
 		 367 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2865  ABC transporter related  38.73 
 
 		 373 aa  259  4e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.95 
 
 		 372 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68586  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3048  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.95 
 
 		 372 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.061373  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  39.02 
 
 		 356 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0692  ABC transporter related protein  37.4 
 
 		 364 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  37.6 
 
 		 370 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01295  putative sugar transport protein  36.48 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.215586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01306  hypothetical protein  36.48 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.157147  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2126  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.95 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1556  maltose ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.95 
 
 		 379 aa  259  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2307  ABC transporter related  36.48 
 
 		 360 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.384254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0786  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.95 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2618  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.95 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.654814  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1994  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.95 
 
 		 372 aa  259  6e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.630648  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1963  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 360 aa  258  9e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.70286 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3082  ABC transporter, ATP-binding component  39.69 
 
 		 379 aa  258  9e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  38.62 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1632  multiple sugar-binding transport, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2099  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein UgpC  36.5 
 
 		 367 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0157125  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  39.03 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1522  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000622253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3854  ABC transporter related  41.29 
 
 		 409 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1897  multiple sugar-binding transport ATP-binding protein  36.27 
 
 		 367 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.105891  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  37.66 
 
 		 355 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0365  ABC transporter related protein  41.54 
 
 		 374 aa  258  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.343115  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06937  sugar ABC transportor ATP-binding protein  37.24 
 
 		 364 aa  258  2e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2549  ABC transporter related  43.38 
 
 		 366 aa  257  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.071435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  36.87 
 
 		 381 aa  256  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1177  ABC transporter related  50 
 
 		 356 aa  256  4e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.675733  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1905  ABC transporter related  35.82 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.303406  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  42.38 
 
 		 358 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1529  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 360 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2036  ABC transporter related  34.41 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0366  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 364 aa  256  5e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.173433  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  38.99 
 
 		 360 aa  256  6e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1278  ABC transporter related  39.54 
 
 		 367 aa  256  6e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.288826  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0946  ABC transporter related  38.44 
 
 		 366 aa  256  7e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.309285 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0474  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.7 
 
 		 378 aa  256  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1044  ABC transporter related  36.36 
 
 		 374 aa  255  8e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3844  ABC transporter related  36.9 
 
 		 366 aa  255  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00035196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1424  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 370 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  36.36 
 
 		 366 aa  254  1.0000000000000001e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  39.32 
 
 		 356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  38.62 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1433  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 360 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4067  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  36.59 
 
 		 366 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.041099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  37.85 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4367  ABC transporter-like  38.24 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2164  ABC transporter related  40.21 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6661  ABC transporter related  41.48 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3931  ABC transporter related protein  51.6 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2142  ABC transporter related  38.21 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0488971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2198  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 375 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797187  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0409  putative maltose ABC transportor  41.97 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0218  ABC-type sugar transport system, ATPase component  35.14 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0122274  hitchhiker  0.000000441743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>