More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0577 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  100 
 
 
256 aa  509  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  92.62 
 
 
263 aa  447  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  88.98 
 
 
262 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  81.85 
 
 
264 aa  411  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  81.01 
 
 
268 aa  408  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  82.73 
 
 
264 aa  401  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  79.92 
 
 
265 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  86.35 
 
 
250 aa  395  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  85.38 
 
 
255 aa  395  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  77.11 
 
 
251 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  77.14 
 
 
268 aa  378  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  72.24 
 
 
261 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  70.92 
 
 
258 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  71.84 
 
 
261 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  71.02 
 
 
258 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  71.02 
 
 
258 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  71.02 
 
 
258 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  70.52 
 
 
262 aa  359  2e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  71.43 
 
 
258 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  71.02 
 
 
258 aa  358  4e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  71.43 
 
 
260 aa  357  9e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  70.61 
 
 
258 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  71.02 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  70.52 
 
 
263 aa  355  5e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  70.61 
 
 
258 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  68.92 
 
 
262 aa  354  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  68.92 
 
 
262 aa  354  5.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  71.02 
 
 
266 aa  350  2e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  67.58 
 
 
255 aa  347  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  68.72 
 
 
255 aa  337  9.999999999999999e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  66.53 
 
 
268 aa  330  2e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  66.53 
 
 
244 aa  328  7e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 
241 aa  314  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  62.14 
 
 
241 aa  314  9.999999999999999e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  61.63 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  62.45 
 
 
240 aa  312  2.9999999999999996e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  61.32 
 
 
241 aa  311  7.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  68.57 
 
 
240 aa  308  5e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  59.67 
 
 
241 aa  308  6.999999999999999e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  62.55 
 
 
247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3178  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  59.84 
 
 
241 aa  300  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  61.69 
 
 
321 aa  299  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  61.38 
 
 
258 aa  298  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  57.96 
 
 
241 aa  298  7e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.55 
 
 
241 aa  297  9e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  9e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  9e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  9e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  61.38 
 
 
258 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  59.26 
 
 
243 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  59.92 
 
 
243 aa  295  4e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  61.32 
 
 
243 aa  295  5e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  61.73 
 
 
243 aa  295  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  61.32 
 
 
243 aa  295  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.26 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.26 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.26 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.26 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  59.26 
 
 
241 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0405  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  60.57 
 
 
268 aa  293  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  58.44 
 
 
241 aa  292  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  58.02 
 
 
241 aa  292  4e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59.29 
 
 
310 aa  292  4e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.61 
 
 
241 aa  292  4e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 
249 aa  291  5e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.61 
 
 
249 aa  291  5e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3087  ABC transporter, ATP-binding protein  60.91 
 
 
243 aa  291  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187467  normal  0.113266 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0955  ABC transporter related  60.91 
 
 
239 aa  291  6e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  58.85 
 
 
241 aa  291  6e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  58.44 
 
 
241 aa  291  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.85 
 
 
241 aa  291  7e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  58.02 
 
 
241 aa  291  7e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0727  ABC transporter-related protein  60.16 
 
 
243 aa  291  8e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.12728 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.85 
 
 
241 aa  291  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  59.59 
 
 
241 aa  291  9e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0960  ABC transporter related  58.85 
 
 
241 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.44 
 
 
241 aa  290  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  58.44 
 
 
241 aa  289  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4146  ABC transporter  58.02 
 
 
241 aa  289  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 
246 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.61 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  58.44 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  60.17 
 
 
256 aa  289  3e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  60.91 
 
 
282 aa  289  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.14 
 
 
250 aa  289  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  60.49 
 
 
243 aa  289  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  57.58 
 
 
289 aa  288  4e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  61.73 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  58.37 
 
 
316 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  58.85 
 
 
259 aa  288  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>