More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5781 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5781  Glutathione S-transferase domain protein  100 
 
 		 217 aa  433  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0789  Glutathione S-transferase domain  75.47 
 
 		 216 aa  325  3e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0079  glutathione S-transferase-like  74.64 
 
 		 221 aa  312  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0926  glutathione S-transferase domain-containing protein  71.76 
 
 		 217 aa  309  2.9999999999999997e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.017472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1077  Glutathione S-transferase domain protein  71.7 
 
 		 216 aa  308  4e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4891  glutathione S-transferase domain-containing protein  70.75 
 
 		 216 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.479159 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1469  glutathione S-transferase-like  68.08 
 
 		 217 aa  295  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368467  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2824  glutathione S-transferase domain-containing protein  69.38 
 
 		 216 aa  290  8e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.480753  normal  0.31564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.53 
 
 		 227 aa  275  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3560  Glutathione S-transferase domain  61.72 
 
 		 213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.945145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3077  glutathione S-transferase-like  49.51 
 
 		 214 aa  191  8e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.187241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2883  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.51 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.527212  normal  0.219041 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5865  glutathione S-transferase-like protein  68.7 
 
 		 166 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0966  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.66 
 
 		 219 aa  174  7e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0016  glutathione S-transferase-like protein  42.23 
 
 		 224 aa  164  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0486825 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1407  Glutathione S-transferase domain protein  39.91 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0606838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0033  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.48 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2330  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.63 
 
 		 210 aa  148  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.639612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8292  Glutathione S-transferase domain protein  42.99 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.28 
 
 		 212 aa  139  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562576  normal  0.573525 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2579  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.16 
 
 		 217 aa  128  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.983145  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2245  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.85 
 
 		 207 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.597175 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3111  putative glutathione S-transferase  38.05 
 
 		 232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.61 
 
 		 232 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00883028  normal  0.988624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5257  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.57 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.619423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5855  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  36.04 
 
 		 201 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  35.53 
 
 		 201 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  34.52 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2509  glutathione S-transferase-like protein  33.16 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.640237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  32.46 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1722  glutathione S-transferase-like protein  30.15 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1349  Glutathione S-transferase domain protein  30.89 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4433  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 222 aa  80.5  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2222  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.8 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.186295 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3767  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0906  hypothetical protein  29.47 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.719726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4110  Glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4150  glutathione S-transferase domain protein  28.57 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.432751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3650  hypothetical protein  31.94 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328113  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1629  glutathione S-transferase  31.16 
 
 		 207 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.197221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2431  Glutathione S-transferase domain  31.31 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.342495  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2200  glutathione S-transferase-like  30.35 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2389  Glutathione S-transferase domain protein  29.9 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.587961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1060  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.02 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.927457 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3798  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59415  normal  0.718162 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  34.36 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2958  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.93 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2778  glutathione S-transferase-like protein  30.69 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.910721 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0769  glutathione S-transferase  32.5 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2427  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.35 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340237  normal  0.0428234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2668  glutathione S-transferase-like  30.57 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  29.7 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1365  glutathione S-transferase  30.57 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.290536  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0539  Glutathione S-transferase domain protein  31.84 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.333365  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3856  glutathione S-transferase family protein  30.81 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1911  glutathione S-transferase  30.53 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  30.99 
 
 		 210 aa  72  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4634  Glutathione transferase  31.73 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2573  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.24 
 
 		 221 aa  72  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.748409  normal  0.500264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 		 205 aa  72  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3264  glutathione S-transferase-like protein  30.65 
 
 		 216 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0652587  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1107  glutathione S-transferase  30.05 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.300035  normal  0.477541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3640  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.33 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.390438 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2005  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.57 
 
 		 202 aa  71.6  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6295  glutathione S-transferase-like protein  29.74 
 
 		 204 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.14476  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2200  Glutathione S-transferase domain  30.69 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1820  glutathione S-transferase-like protein  31.82 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.631165 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2196  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.69 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.827244 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1924  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.16 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.896239 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1175  glutathione S-transferase  29.02 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275426  normal  0.372199 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1626  Glutathione S-transferase domain  30.84 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.506745  normal  0.230633 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3629  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.395815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1961  glutathione S-transferase-like  46.07 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3310  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.8 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.141117  normal  0.680332 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3752  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0132369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5110  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.61 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0347901 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3706  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.63 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.65 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4821  Glutathione S-transferase domain protein  32.24 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3513  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.93 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.72335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.59 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2090  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.17 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.403275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3205  glutathione S-transferase-like  30.57 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.877532  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00398  glutathione S-transferase  28.77 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.995047  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2329  glutathione S-transferase-like  29.23 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2306  Glutathione S-transferase domain protein  29 
 
 		 229 aa  68.2  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0027483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.16 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2943  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.23 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.5 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1955  Glutathione S-transferase domain  30.37 
 
 		 208 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0193951  normal  0.329521 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  31.41 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2547  glutathione S-transferase-like  28.42 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.277247  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  30 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  32.18 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4135  glutathione S-transferase-like  27.67 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.354502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3623  Glutathione S-transferase domain  32.68 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4290  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.54 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.380653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0681  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.43 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.052324  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>