More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1961 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1961  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.255462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0039  glutathione S-transferase-like protein  36.2 
 
 		 218 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0243  glutathione S-transferase-like  33.78 
 
 		 220 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2423  putative glutathione S-transferase  36.07 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171803  normal  0.428132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2979  glutathione S-transferase  31.82 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.978891  normal  0.125467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3680  glutathione S-transferase  34.86 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2653  Glutathione S-transferase domain  33.02 
 
 		 211 aa  97.8  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.520035  normal  0.305227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22620  Glutathione S-transferase protein  32.87 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.453028  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4145  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.86 
 
 		 203 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.167022 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2749  putative glutathione S-transferase  33.33 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0888  Glutathione S-transferase domain  31.48 
 
 		 204 aa  93.6  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1190  glutathione S-transferase (BphK)  33.03 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.557272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1471  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.65 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.214549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1904  Glutathione S-transferase domain protein  31.02 
 
 		 201 aa  91.3  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5316  Glutathione S-transferase domain  31.13 
 
 		 220 aa  89  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.591495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4988  glutathione S-transferase-like protein  29.91 
 
 		 215 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4603  glutathione S-transferase-like protein  30.09 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0387  glutathione S-transferase-like  30.84 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2161  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.72 
 
 		 199 aa  86.7  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0310  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 202 aa  85.5  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0808  glutathione S-transferase-like  30.56 
 
 		 204 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513928  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1012  glutathione S-transferase-like protein  30.09 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0818  glutathione S-transferase  31.94 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3309  glutathione S-transferase protein  30.91 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1729  Glutathione S-transferase domain protein  32.27 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2574  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.94 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127653 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0456  glutathione S-transferase-like  31.03 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2358  Glutathione S-transferase domain protein  30.77 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.426471  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5791  glutathione S-transferase  28.51 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3179  Glutathione S-transferase domain protein  30.56 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3504  Glutathione S-transferase domain  30.56 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0349421 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1781  glutathione S-transferase, putative  31.19 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.488654  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2477  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.09 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1696  Glutathione S-transferase domain protein  31.36 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3814  Glutathione S-transferase domain  31.51 
 
 		 198 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.652341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0798  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.12 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.808485  normal  0.965794 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3859  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.56 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.825157  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1459  glutathione S-transferase-like protein  33.99 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0619383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0074  glutathione S-transferase  30.41 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1679  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.86 
 
 		 205 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.141401  normal  0.230284 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0047  glutathione S-transferase-like  31.39 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0240  glutathione S-transferase domain protein  32.23 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22530  putative glutathione S-transferase  31.19 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000234667  hitchhiker  0.0000170286 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3410  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.822464  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2345  glutathione S-transferase, putative  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3417  glutathione S-transferase, putative  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0270497  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5431  Glutathione S-transferase domain protein  30.88 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3374  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0444471  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2523  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3527  Glutathione S-transferase domain protein  29.67 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.11732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0257  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1119  putative glutathione S-transferase  37.19 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2223  Glutathione S-transferase domain  29.63 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.809628  normal  0.501649 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0108  glutathione S-transferase-like  28.5 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2594  glutathione S-transferase  29.63 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.287653  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3463  glutathione S-transferase domain protein  29.67 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0942071  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5526  Glutathione S-transferase domain protein  29.81 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.714994  hitchhiker  0.000295596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0090  glutathione S-transferase  32.02 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162685  normal  0.0936415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0406  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.157624  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1002  glutathione S-transferase, putative  29.17 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1237  glutathione S-transferase, putative  36.36 
 
 		 234 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00250185  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1580  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.67 
 
 		 234 aa  75.1  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.758866  normal  0.296422 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4017  glutathione S-transferase-like  33.54 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.84 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0944  putative glutathione S-transferase  29.63 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.357934  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2221  glutathionine S-transferase  29.17 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0005501 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3435  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.6 
 
 		 222 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.288694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3380  glutathione S-transferase-like protein  29.19 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0097  glutathione S-transferase-like  32.57 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.472902  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1139  Glutathione S-transferase domain  33.52 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.328296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3750  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.16 
 
 		 234 aa  73.9  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.5505  normal  0.556027 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3350  putative glutathione S-transferase  33.77 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1298  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.7 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.323445  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1564  Glutathione S-transferase domain  28.7 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0795  Glutathione S-transferase domain  29.49 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122323  normal  0.149392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4489  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.25 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0097  glutathione S-transferase-like protein  33.75 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.303692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43530  hypothetical protein  33.08 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4710  glutathione S-transferase family protein  30.11 
 
 		 225 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.352586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1563  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.1 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.221401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1831  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0468  Glutathione S-transferase domain  27.23 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1087  glutathione S-transferase family protein  33.58 
 
 		 222 aa  72  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.983271 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1850  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.15 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185574 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0847  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.67 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.154484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3732  Glutathione S-transferase domain protein  33.33 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2935  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.09 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1529  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.96 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.623828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4356  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.46 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2937  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.23 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4394  Glutathione S-transferase domain  28.57 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.297541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1147  Glutathione S-transferase domain  32.45 
 
 		 235 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03306  putative glutathione S-transferase protein  37.62 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00013946  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3984  glutathione S-transferase domain-containing protein  32 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.31338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2303  Glutathione S-transferase domain protein  28.95 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0188012  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3752  glutathione S-transferase-like protein  34 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0129793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4836  glutathione S-transferase-like protein  34 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.33242  hitchhiker  0.00725172 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3950  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.96 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.532798  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0127  glutathione S-transferase family protein  32.92 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0176618  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0042  Glutathione S-transferase domain protein  29.17 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>