112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4302 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 286 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30570  membrane protein  51.42 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  43.71 
 
 		 287 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.98 
 
 		 293 aa  159  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  37.89 
 
 		 288 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  39.93 
 
 		 299 aa  156  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.63 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  38.95 
 
 		 303 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  35.99 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  37.81 
 
 		 290 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  38.25 
 
 		 290 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  37.63 
 
 		 293 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  37.82 
 
 		 290 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  38.18 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1077  hypothetical protein  43.31 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.407086 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  35.84 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  34.47 
 
 		 285 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  37.44 
 
 		 287 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  38.43 
 
 		 303 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  37.04 
 
 		 251 aa  99  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  34.97 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  34.97 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  31.45 
 
 		 279 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5358  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.1 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.961807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2940  hypothetical protein  33.71 
 
 		 280 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0704111  hitchhiker  0.00163659 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  31.03 
 
 		 281 aa  92.4  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.23 
 
 		 281 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.69 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  31.19 
 
 		 275 aa  85.5  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2272  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1949  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.58 
 
 		 277 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0296573  normal  0.100068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.51 
 
 		 286 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.72 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  29.24 
 
 		 276 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  30.47 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0566  DMT family permease  31.64 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.7079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  31.51 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 277 aa  79.3  0.00000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2218  hypothetical protein  30.8 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0823132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  30.21 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  31.01 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  27.95 
 
 		 280 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  31.53 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0498  hypothetical protein  31.18 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.146008  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  26.88 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4078  integral membrane protein  29.56 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4128  integral membrane protein  29.56 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4023  integral membrane protein  29.56 
 
 		 286 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4186  integral membrane protein  29.18 
 
 		 277 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  29.58 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  32.72 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  27.07 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4007  integral membrane protein  29.56 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1842  drug/metabolite exporter (DME) family protein  30.18 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.129137  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0491  hypothetical protein  30.18 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.177704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  29.17 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  29.23 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  33.63 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  29.68 
 
 		 293 aa  72  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0631  hypothetical protein  31.08 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.945692 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  32.11 
 
 		 278 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  30.07 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  31.65 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  31.65 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  31.02 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  31.42 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0642  hypothetical protein  30.63 
 
 		 276 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  28.52 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2724  hypothetical protein  32.45 
 
 		 300 aa  66.6  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.35059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07010  hypothetical protein  30.28 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0071  integral membrane protein  30.86 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.13911  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1570  hypothetical protein  30.86 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.232738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1482  hypothetical protein  30.86 
 
 		 278 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.133803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0997  hypothetical protein  32.47 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  27.84 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1215  hypothetical protein  27.4 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  27.89 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  28.29 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.95 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  27.33 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2117  hypothetical protein  33.02 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29520  membrane protein  33.02 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.26 
 
 		 290 aa  62.4  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  29.95 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3941  hypothetical protein  29.55 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.177323  normal  0.483872 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  26.47 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  26.96 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  29.33 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4973  hypothetical protein  28.62 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5275  hypothetical protein  28.57 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5022  hypothetical protein  28.97 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4846  hypothetical protein  28.62 
 
 		 277 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1941  hypothetical protein  28.87 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.192478  normal  0.151746 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2854  hypothetical protein  31.43 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  26.94 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  25.35 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0492  hypothetical protein  27.46 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1474  hypothetical protein  32.41 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>