291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2912 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2912  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
239 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0699  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  57.47 
 
 
238 aa  276  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0365  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  60.7 
 
 
236 aa  274  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.393782 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3160  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  52.29 
 
 
233 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0330  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  42.25 
 
 
222 aa  169  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.234975  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2972  FMN-dependent NADH-azoreductase  36.82 
 
 
219 aa  165  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0140  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  38.81 
 
 
229 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.294363 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0135  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.36 
 
 
229 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5707  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.82 
 
 
221 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.333359  normal  0.171433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1062  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.86 
 
 
207 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00142617  decreased coverage  0.00000237921 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3715  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.24 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.336776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1165  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.46 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0025  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.25 
 
 
207 aa  132  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0121631 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54120  acyl carrier protein phosphodiesterase  43.08 
 
 
212 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2757  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
205 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.283437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  38.3 
 
 
215 aa  122  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4734  acyl carrier protein phosphodiesterase  40.51 
 
 
212 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3545  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35 
 
 
207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114749  normal  0.056833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0809  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  39.15 
 
 
203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2242  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.21 
 
 
202 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.679145  normal  0.255762 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2372  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.45 
 
 
216 aa  116  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.96964 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0569  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.26 
 
 
212 aa  115  6e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.380766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4044  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.29 
 
 
199 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.91788 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.24 
 
 
199 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.352068  normal  0.822829 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1540  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.05 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.422429  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0956  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.04 
 
 
207 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2531  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.24 
 
 
210 aa  111  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4538  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
199 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332795  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2059  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  30.73 
 
 
202 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000039255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19110  Acyl-carrier protein phosphodiesterase  34.6 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1353  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
204 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.886307  normal  0.112271 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4593  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.48 
 
 
212 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.703908  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5994  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.56 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.396408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1517  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.89 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.39065  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2340  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.89 
 
 
216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370827  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5629  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.56 
 
 
201 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.254854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4469  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.61 
 
 
204 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3831  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
199 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2600  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  38.5 
 
 
193 aa  109  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1432  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.38 
 
 
199 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0560  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.99 
 
 
199 aa  108  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.737585  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0973  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
208 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.22 
 
 
206 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598648 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0447  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
204 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2541  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.59 
 
 
213 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0403619  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2721  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.84 
 
 
207 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2018  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
227 aa  106  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.042412 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1965  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
202 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0222765 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0629  phosphodiesterase  31.89 
 
 
211 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.936388  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2020  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.61 
 
 
204 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.818794  normal  0.0710371 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1426  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.54 
 
 
224 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.681174  normal  0.04956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4014  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.85 
 
 
218 aa  102  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00878582  normal  0.0584137 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2663  NADH-azoreductase, FMN-dependent  35.48 
 
 
201 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.62619  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3238  hypothetical protein  33.67 
 
 
196 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7380  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  34.74 
 
 
201 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.729471  normal  0.42144 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6485  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.1 
 
 
201 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4152  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
208 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4264  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.32 
 
 
208 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.772372  normal  0.532472 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1903  acyl carrier protein phosphodiesterase  35.45 
 
 
213 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1258  putative [Acyl-carrier-protein] phosphodiesterase  35.98 
 
 
208 aa  99.8  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22490  acyl carrier protein phosphodiesterase  34.55 
 
 
213 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000089212  hitchhiker  0.0000070742 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39150  azoreductase  36.36 
 
 
202 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.63427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0290  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.39 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2586  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  34.6 
 
 
202 aa  98.6  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2606  azoreductase  30.99 
 
 
203 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.49805 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1510  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  37.57 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6319  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  37.57 
 
 
232 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.574941 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3136  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.37 
 
 
202 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00683712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2282  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 
198 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1679  FMN-dependent NADH-azoreductase  35.48 
 
 
192 aa  95.9  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2823  azoreductase  35.83 
 
 
203 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3003  azoreductase  29.44 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4165  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  36.2 
 
 
182 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.575479  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3334  azoreductase  34.41 
 
 
202 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4872  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  35.23 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3293  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  35.23 
 
 
214 aa  95.5  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6977  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.181863  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2002  azoreductase  33.49 
 
 
202 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0549421  hitchhiker  0.00845677 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2752  azoreductase  35.83 
 
 
203 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.29 
 
 
201 aa  95.1  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226705  normal  0.672603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 
222 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.664056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2866  azoreductase  35.83 
 
 
203 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6004  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.28 
 
 
211 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.40522  normal  0.134748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1775  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  36.56 
 
 
197 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3298  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.91 
 
 
199 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.735887  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1391  NAD(P)H dehydrogenase (quinone):NADPH-dependent FMN reductase  30.73 
 
 
199 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000126863  normal  0.271745 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1996  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.29 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122923  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6637  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.92 
 
 
205 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01367  acyl carrier protein phosphodiesterase  30.39 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01379  hypothetical protein  30.39 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1514  azoreductase  33.82 
 
 
201 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1441  (Acyl-carrier protein) phosphodiesterase  32.49 
 
 
206 aa  92.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1822  azoreductase  33.82 
 
 
201 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1759  azoreductase  33.82 
 
 
201 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.131537  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2915  azoreductase  35.29 
 
 
203 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1762  azoreductase  33.82 
 
 
201 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0641647 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1697  azoreductase  33.82 
 
 
201 aa  92.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217303 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3461  (Acyl-carrier-protein) phosphodiesterase  31.63 
 
 
196 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1947  azoreductase  32.2 
 
 
201 aa  91.3  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0306  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.45 
 
 
209 aa  91.3  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>