More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2845 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  61.44 
 
 		 574 aa  757    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1942  Serine/threonine protein kinase  62.84 
 
 		 621 aa  711    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.869766 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3613  serine/threonine protein kinase  59.47 
 
 		 577 aa  690    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.374938  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2825  serine/threonine protein kinase  54.82 
 
 		 574 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.766433  hitchhiker  0.00137239 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0330  serine/threonine protein kinase  61.72 
 
 		 574 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  58.43 
 
 		 572 aa  665    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2845  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 577 aa  1177    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.36762  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0704  serine/threonine protein kinase  52.88 
 
 		 569 aa  620  1e-176  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0336836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1244  serine/threonine protein kinase  55.76 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1132  protein kinase  55.94 
 
 		 571 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  50.81 
 
 		 569 aa  585  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3479  protein serine/threonine phosphatases  51.32 
 
 		 580 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.644953  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3139  serine/threonine protein kinase  54.74 
 
 		 585 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0181  protein kinase  50.36 
 
 		 579 aa  567  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2279  serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 574 aa  435  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0942803 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1878  serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 		 599 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.686913  hitchhiker  0.00272261 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1512  serine/threonine protein kinase  37.48 
 
 		 596 aa  432  1e-120  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0248  putative membrane associated protein kinase  37.93 
 
 		 590 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2627  protein serine/threonine phosphatase  37.61 
 
 		 576 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0575166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1963  serine/threonine protein kinase  38.09 
 
 		 576 aa  428  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  37.07 
 
 		 606 aa  429  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03878  Serine/threonine protein kinase  38.6 
 
 		 586 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1021  serine/threonine protein kinase  37.33 
 
 		 589 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.867163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1814  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 		 596 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2418  serine/threonine protein kinase  37.13 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4949  serine/threonine protein kinase  38.51 
 
 		 610 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3713  protein kinase  38.39 
 
 		 591 aa  393  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02559  Serine/threonine protein kinase  37.4 
 
 		 605 aa  390  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2280  serine/threonine protein kinase  33.09 
 
 		 548 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187654  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1782  protein serine/threonine phosphatase  32.67 
 
 		 556 aa  280  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3523  putative serine/threonine-protein kinase  34.65 
 
 		 555 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1609  protein serine/threonine phosphatase  32.25 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122256  decreased coverage  0.000000000229317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2091  serine/threonine-protein kinase, putative  32.67 
 
 		 556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0473599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0593  protein phosphatase/kinase family protein  33.39 
 
 		 595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2097  protein kinase  33.57 
 
 		 554 aa  270  8e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0694444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3649  protein kinase  32.67 
 
 		 556 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0234168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2101  protein kinase  31.94 
 
 		 553 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1786  hitchhiker  0.00815198 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1602  protein serine/threonine phosphatase  33.33 
 
 		 556 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.022391  hitchhiker  0.00581256 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0826  protein kinase:protein phosphatase 2C-like  33.99 
 
 		 562 aa  267  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3205  protein serine/threonine phosphatase  33.27 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.252613 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41520  putative serine/threonine-protein kinase  34.67 
 
 		 533 aa  263  8.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2303  serine/threonine protein kinase, putative  31.48 
 
 		 529 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42838  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2971  protein serine/threonine phosphatases  32.46 
 
 		 563 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.59777  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23380  serine/threonine-kinase and phosphatase  31.62 
 
 		 559 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0320  protein serine/threonine phosphatases  32.25 
 
 		 565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2316  putative serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 573 aa  233  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.943613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3274  protein serine/threonine phosphatases  30.3 
 
 		 594 aa  230  4e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.35703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3527  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 566 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1410  protein kinase  30.66 
 
 		 582 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.840602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2677  protein serine/threonine phosphatase  30.09 
 
 		 580 aa  209  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1550  protein kinase  25.79 
 
 		 667 aa  199  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.05919 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1321  serine/threonine protein kinase  25.45 
 
 		 700 aa  183  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  29.7 
 
 		 666 aa  139  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1146  protein serine/threonine phosphatase  39.01 
 
 		 705 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.694371  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  30.15 
 
 		 614 aa  130  9.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.38 
 
 		 668 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0995  protein kinase  32.84 
 
 		 586 aa  127  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3840  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 466 aa  127  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  29.32 
 
 		 776 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0764  serine/threonine kinase protein  29.28 
 
 		 662 aa  126  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395129 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  27.82 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3699  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  30.8 
 
 		 666 aa  125  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1100  serine/threonine protein kinase  33.72 
 
 		 1415 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  27.8 
 
 		 625 aa  125  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3350  protein kinase  28.47 
 
 		 465 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3472  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.04 
 
 		 916 aa  124  6e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00045069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3757  serine/threonine protein kinase  31 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  30.31 
 
 		 673 aa  123  9e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1511  serine/threonine kinase protein  30.19 
 
 		 641 aa  123  9e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1033  protein kinase  30.92 
 
 		 586 aa  123  9e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.94 
 
 		 627 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2033  protein kinase  28.18 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.960362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0525  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.81 
 
 		 880 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 517 aa  121  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0870  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 		 328 aa  121  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 		 750 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.37 
 
 		 527 aa  120  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5237  protein kinase  31.56 
 
 		 583 aa  120  7e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf717  serine/threonine protein kinase  29.21 
 
 		 332 aa  120  9e-26  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  27.2 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1169  protein kinase  29.77 
 
 		 634 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000304799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  27.2 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.24 
 
 		 528 aa  118  3e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.68 
 
 		 653 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3668  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.2 
 
 		 553 aa  117  3.9999999999999997e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.965868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  29.43 
 
 		 863 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3685  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.64 
 
 		 657 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.210183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2514  protein kinase  27.01 
 
 		 656 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0149457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3910  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  117  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3491  protein kinase  27.87 
 
 		 481 aa  116  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.201999  normal  0.195124 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3961  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.95648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0458  serine/threonine protein kinase  28.29 
 
 		 593 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.11555  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1282  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00711344 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3603  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3621  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4000  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.48 
 
 		 598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3876  serine/threonine protein kinase  26.45 
 
 		 657 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.95559e-22 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  24.37 
 
 		 703 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>