260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1458 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1458  YCII-related  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2831  DGPFAETKE family protein  70.07 
 
 		 138 aa  200  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.618861  normal  0.707195 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3531  DGPFAETKE family protein  70.42 
 
 		 143 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3708  DGPFAETKE family protein  70.21 
 
 		 145 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.229966  normal  0.769344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3488  DGPFAETKE  67.38 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3654  YCII-related protein  64.71 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.046895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2519  DGPFAETKE  64.49 
 
 		 141 aa  186  8e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278396  normal  0.095455 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4525  DGPFAETKE family protein  65.03 
 
 		 143 aa  186  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3123  DGPFAETKE family protein  68.15 
 
 		 141 aa  186  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.265819  normal  0.0263064 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5048  DGPFAETKE family protein  64.34 
 
 		 143 aa  186  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.291625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1584  DGPFAETKE  65.96 
 
 		 143 aa  183  7e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5169  DGPFAETKE family protein  61.97 
 
 		 143 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0803026 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3256  hypothetical protein  61.97 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5112  DGPFAETKE family protein  61.97 
 
 		 143 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8315  YCII-related  64.93 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11198  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4212  DGPFAETKE family protein  60 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.380376 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4029  hypothetical protein  70.97 
 
 		 141 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46770  hypothetical protein  70.97 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0208952  decreased coverage  0.000000131045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2458  YCII-related  64.18 
 
 		 140 aa  173  8e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6196  YCII-related protein  62.14 
 
 		 140 aa  168  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2572  DGPFAETKE family protein  59.85 
 
 		 140 aa  166  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.725199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0528  hypothetical protein  58.27 
 
 		 143 aa  164  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252797  normal  0.454149 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1750  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.605944  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0988  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0384  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391971  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1835  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.565065  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1339  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.071027  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0256  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 243 aa  163  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.162797  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0310  DGPF domain-containing protein  57.04 
 
 		 246 aa  163  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.471649  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1126  DGPF domain-containing protein  59.7 
 
 		 145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0193856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3657  YCII-related  60.15 
 
 		 147 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  55.22 
 
 		 391 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3588  DGPFAETKE family protein  59.4 
 
 		 147 aa  154  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3500  DGPFAETKE  59.4 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.161886  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1484  hypothetical protein  54.01 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.786004 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0232  hypothetical protein  60.16 
 
 		 137 aa  147  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0795  hypothetical protein  52.99 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2452  DGPFAETKE family protein  52.99 
 
 		 139 aa  147  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0408545 
 
 
-
 
NC_003296  RS03730  hypothetical protein  60 
 
 		 143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988914  normal  0.724741 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2634  DGPF domain-containing protein  59.17 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821675  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2496  DGPF domain-containing protein  59.17 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0929  DGPF domain-containing protein  59.17 
 
 		 137 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8235  YCII-related protein  52.27 
 
 		 139 aa  145  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0410  DGPFAETKE family protein  52.55 
 
 		 137 aa  144  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00435378  normal  0.146566 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0261  hypothetical protein  58.33 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1442  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1639  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0294  DGPF domain-containing protein  58.33 
 
 		 137 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.360873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3321  histidine kinase  55.47 
 
 		 284 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000411841 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0534  DGPF domain-containing protein  55.83 
 
 		 137 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.362719  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4025  hypothetical protein  54.62 
 
 		 149 aa  141  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7113  DGPFAETKE family protein  55.15 
 
 		 137 aa  140  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0694  hypothetical protein  51.37 
 
 		 279 aa  139  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0969715  unclonable  0.00000000507336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1702  YCII-related protein  48.59 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1320  DGPFAETKE family protein  57.85 
 
 		 122 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.746126  normal  0.587484 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2421  DGPFAETKE domain-containing protein  56.45 
 
 		 145 aa  136  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19760  hypothetical protein  48.94 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.113314  hitchhiker  0.00158371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4361  DGPFAETKE family protein  55.83 
 
 		 137 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0021  hypothetical protein  52.59 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.512817 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5538  DGPFAETKE family protein  52.85 
 
 		 140 aa  129  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5551  YCII-related protein  44.76 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.622924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3924  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.762923  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4551  hypothetical protein  52.03 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.626002  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3812  DGPFAETKE family protein  52.03 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3712  DGPFAETKE family protein  52.03 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3713  DGPFAETKE family protein  51.22 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.794137  normal  0.315323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5462  YCII-related protein  47.86 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.330293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2284  hypothetical protein  51.22 
 
 		 139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0918561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4927  DGPFAETKE family protein  52.85 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0785882 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8414  YCII-related  52.34 
 
 		 144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4155  hypothetical protein  50.38 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0734985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1303  DGPFAETKE family protein  49.21 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0580  DGPFAETKE family protein  52.54 
 
 		 261 aa  116  9e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4099  DGPFAETKE family protein  48.33 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1804  DGPF protein  50.85 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0349  YCII-related protein  48.28 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0677816 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2197  DGPFAETKE domain-containing protein  48.36 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.936751  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1459  YCII-related  47.06 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6888  hypothetical protein  50 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.0297541 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0199  DGPFAETKE domain-containing protein  50 
 
 		 138 aa  110  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.301875 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3518  hypothetical protein  46.61 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.382158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2972  hypothetical protein  40.97 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2136  YCII-related protein  43.7 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5826  hypothetical protein  44.44 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.924088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18250  hypothetical protein  44.54 
 
 		 139 aa  99  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2841  YCII-related protein  42.61 
 
 		 135 aa  98.2  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.903735  decreased coverage  0.00264181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3642  DGPFAETKE family protein  43.59 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.610732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0741  DGPFAETKE domain-containing protein  43.75 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0755  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.19239 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0735  DGPFAETKE family protein  43.75 
 
 		 168 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.208807  normal  0.29504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4076  YCII-related protein  41.18 
 
 		 138 aa  87  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0077  YCII-related  35.82 
 
 		 142 aa  85.1  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.35045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2144  YCII-related protein  41.23 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3319  YCII-related  38.76 
 
 		 251 aa  80.5  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4225  DGPF domain-containing protein  41.07 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.81583  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3416  YCII-related protein  33.04 
 
 		 119 aa  72.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.162675  hitchhiker  0.00509587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5743  YCII-related protein  33.62 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0283  YCII-related protein  40.68 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0868  YCII-related protein  42.48 
 
 		 108 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  0.218022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1521  YCII-related protein  38 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000673434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>