More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0355 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0355  membrane associated sensor histidine kinase  100 
 
 		 479 aa  975    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127376  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0239  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 478 aa  350  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0799  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.88 
 
 		 493 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00386  putative sensor transduction kinase (copper resistance)  33.33 
 
 		 479 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2713  sensor histidine kinase  33.26 
 
 		 479 aa  241  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.725712  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3015  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.86 
 
 		 470 aa  99.8  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307553 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  24.83 
 
 		 454 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2713  histidine kinase  23.6 
 
 		 470 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.603584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 495 aa  89  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.07 
 
 		 471 aa  87  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0135  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 		 455 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0665221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 465 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0290384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1895  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00272877  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 465 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000014063  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2398  histidine kinase  28.23 
 
 		 465 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00201135  normal  0.0208658 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  24.92 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1097  histidine kinase  28.07 
 
 		 477 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  26.29 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  24.92 
 
 		 478 aa  85.5  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 607 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  23.59 
 
 		 469 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 462 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.89546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1886  ATPase domain-containing protein  28.46 
 
 		 464 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.4 
 
 		 466 aa  83.6  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.16 
 
 		 477 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6296  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 464 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162376  normal  0.252701 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6336  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.05 
 
 		 450 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337613  normal  0.66239 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 		 610 aa  83.2  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 627 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0997  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.171327  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1828  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 466 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0770919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 		 500 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1254  hypothetical protein  23.47 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.73 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 581 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.73 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1782  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 466 aa  81.6  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.28 
 
 		 587 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 481 aa  81.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0512  histidine kinase  25.51 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.28 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.28 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.28 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.28 
 
 		 587 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.28 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 587 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0016  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  21.88 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.17 
 
 		 466 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00327402  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0792  histidine kinase  24.04 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.86 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  21.1 
 
 		 509 aa  79.3  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.63 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1926  histidine kinase  25.24 
 
 		 323 aa  79.3  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.218105  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 469 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  29.28 
 
 		 587 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.8 
 
 		 1352 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 605 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  25.24 
 
 		 592 aa  78.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5470  histidine kinase  23.64 
 
 		 467 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0102378  hitchhiker  0.00183313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  24.76 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45870  putative two-component sensor  23.32 
 
 		 481 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  24.39 
 
 		 402 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 815 aa  77.8  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  24.34 
 
 		 773 aa  77  0.0000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1253  hypothetical protein  22.74 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0122  histidine kinase  26.54 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 596 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0405734 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 453 aa  77  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  26.58 
 
 		 463 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 487 aa  77  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1092  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 464 aa  76.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 585 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  23.02 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  24.25 
 
 		 518 aa  76.3  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1945  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 371 aa  76.3  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2769  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4758  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0298774  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3409  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 469 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  25 
 
 		 401 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3891  putative two-component sensor  23.37 
 
 		 473 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.81053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  23.49 
 
 		 501 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  25.4 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 364 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  22.29 
 
 		 463 aa  75.5  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0198  two-component system sensor protein, histidine kinase  25.69 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00722417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 2783 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  25.25 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1224  histidine kinase  27.95 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.925604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0801  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>