More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2504 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2504  putative ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003795  ABC transporter ATP-binding protein YnjD  71.07 
 
 		 215 aa  300  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.260777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02680  hypothetical protein  69.04 
 
 		 215 aa  293  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1271  putative ABC transporter, ATP-binding protein  62.87 
 
 		 220 aa  270  1e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.481106  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2770  ABC transporter ATP-binding protein  56.54 
 
 		 213 aa  228  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154794  normal  0.0956097 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1691  ABC transporter related  52.91 
 
 		 206 aa  199  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2005  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2475  ABC transporter, ATP-binding protein  47.87 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1979  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 217 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.289049  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1434  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 		 217 aa  181  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.382554  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01725  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  46.81 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1886  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1840  ABC transporter, ATP-binding protein  46.81 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1876  ABC transporter related  46.81 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335299 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01713  hypothetical protein  46.81 
 
 		 217 aa  180  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2961  ABC transporter related  50 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1444  ABC transporter related  47.34 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.595469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3224  ABC transporter related  48.88 
 
 		 224 aa  175  3e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4044  ABC transporter related  51.12 
 
 		 213 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01791  putative ABC transporter ATP-binding protein  49.71 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0263167  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3276  ABC transporter related  47.51 
 
 		 227 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2440  ABC transporter related  47.78 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0587803  normal  0.683858 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0974  ABC transporter related  47.7 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0234767 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2253  ABC transporter related  51.46 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6101  ABC transporter, ATPase subunit  45.03 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0101171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1834  ABC transporter related  45.03 
 
 		 214 aa  161  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.89 
 
 		 352 aa  157  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2155  ABC transporter-related protein  49.41 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000406105 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2329  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.65 
 
 		 326 aa  154  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000238837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 375 aa  154  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 353 aa  154  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 356 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  44.38 
 
 		 353 aa  154  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  43.09 
 
 		 367 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0391  ABC transporter related  40.31 
 
 		 226 aa  152  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 329 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  42.16 
 
 		 329 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  43.78 
 
 		 326 aa  151  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 329 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 329 aa  151  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  43.33 
 
 		 363 aa  151  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 330 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  42.16 
 
 		 329 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1776  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 352 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  43.78 
 
 		 326 aa  150  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.32 
 
 		 353 aa  150  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1286  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 369 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.245798  normal  0.231745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.16 
 
 		 371 aa  150  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 329 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 		 362 aa  150  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5066  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  44.26 
 
 		 367 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.478807  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 375 aa  150  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2467  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit, CysA  41.94 
 
 		 352 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37453  normal  0.40558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.62 
 
 		 330 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1626  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 352 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.220073  normal  0.514504 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.47 
 
 		 375 aa  150  1e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  42.47 
 
 		 323 aa  150  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4042  ABC transporter related  43.17 
 
 		 360 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.643948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3948  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.2 
 
 		 377 aa  149  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0770122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.01 
 
 		 365 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.24 
 
 		 354 aa  149  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  42.22 
 
 		 333 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 374 aa  149  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1223  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.78 
 
 		 369 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243512  normal  0.134553 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  39.78 
 
 		 364 aa  149  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  41.11 
 
 		 352 aa  148  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4007  sulphate transport system permease protein 1  42.16 
 
 		 349 aa  148  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.451546 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  42.16 
 
 		 362 aa  149  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2900  ABC transporter related  43.18 
 
 		 353 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2640  ABC transporter related  43.18 
 
 		 353 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.151039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2703  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.54 
 
 		 359 aa  147  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.76714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2757  sulphate transport system permease protein 1  41.62 
 
 		 349 aa  147  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.194573  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0550  ABC transporter related  43.24 
 
 		 389 aa  147  8e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.698087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 330 aa  147  9e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  40.88 
 
 		 366 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1347  sulfate transport ATP-binding ABC transporter protein  43.24 
 
 		 372 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.7 
 
 		 354 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 367 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  42.16 
 
 		 329 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.78 
 
 		 359 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4969  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.72 
 
 		 367 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.149791  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 		 366 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5188  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.72 
 
 		 367 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583464  normal  0.706165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1500  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 352 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.823264  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4790  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.17 
 
 		 366 aa  145  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165065  hitchhiker  0.0000108781 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1520  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.94 
 
 		 352 aa  145  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.34383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1062  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.64 
 
 		 387 aa  145  3e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2065  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 		 351 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.981525  normal  0.53005 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5299  ABC transporter related  43.72 
 
 		 367 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0629612  hitchhiker  0.0055126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.54 
 
 		 330 aa  145  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3068  ABC transporter related  43.72 
 
 		 367 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.128785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 		 332 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4728  ABC transporter related  43.09 
 
 		 360 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.871256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1227  ABC transporter related  37.04 
 
 		 379 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000640126 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3635  ABC transporter related  43.09 
 
 		 360 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 343 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0349  ABC transporter, ATPase subunit  43.17 
 
 		 367 aa  145  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448761  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4431  ABC transporter related  42.54 
 
 		 363 aa  145  5e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.140949  normal  0.44138 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.72 
 
 		 367 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1864  sulfate/thiosulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.01 
 
 		 351 aa  144  6e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>