40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06554 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  573  1.0000000000000001e-162  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  90.94 
 
 		 281 aa  517  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  70.4 
 
 		 282 aa  408  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  69.02 
 
 		 304 aa  371  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  63.93 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  63.93 
 
 		 308 aa  368  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  63.57 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  63.57 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 		 297 aa  240  2e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 290 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  42.62 
 
 		 305 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  34.81 
 
 		 151 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.97 
 
 		 927 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.28 
 
 		 736 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1138 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  39.47 
 
 		 250 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 750 aa  50.1  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 699 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 		 1979 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.1 
 
 		 573 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00551  hypothetical protein  29.89 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.276796  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 3560 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.89 
 
 		 738 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 375 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 250 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 687 aa  44.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.61 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 523 aa  43.9  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0420  TPR-domain containing protein  31.52 
 
 		 791 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 543 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0703  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 197 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.247899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1273  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 879 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 617 aa  42.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0309  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 116 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.143166  normal  0.277708 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.05 
 
 		 267 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.5 
 
 		 602 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>