More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0614 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0614  30S ribosomal protein S12  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000753493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  75.91 
 
 		 137 aa  205  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf315  30S ribosomal protein S12  72.26 
 
 		 138 aa  205  2e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.113273  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  75.74 
 
 		 140 aa  204  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  75 
 
 		 140 aa  204  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  74.26 
 
 		 140 aa  201  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 137 aa  200  7e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 137 aa  197  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 139 aa  197  6e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 140 aa  196  9e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 137 aa  194  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  74.07 
 
 		 151 aa  194  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 139 aa  192  1e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 		 146 aa  192  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  70.9 
 
 		 135 aa  191  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  73.53 
 
 		 137 aa  191  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  74.05 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  72.79 
 
 		 137 aa  190  5e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  71.32 
 
 		 137 aa  189  7e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  69.5 
 
 		 140 aa  189  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0187  30S ribosomal protein S12  72.99 
 
 		 137 aa  188  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000318944  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  67.86 
 
 		 145 aa  187  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  69.57 
 
 		 140 aa  186  7e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  70.37 
 
 		 144 aa  183  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 		 128 aa  183  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  66.42 
 
 		 135 aa  181  3e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  68.57 
 
 		 142 aa  179  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 		 129 aa  179  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 		 128 aa  178  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1189  ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  178  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000946839  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 		 124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 		 128 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0226  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  177  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1833  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 202 aa  177  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0567288  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0194  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0259871  hitchhiker  0.00000480785 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0189  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  177  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.019095  decreased coverage  0.000333311 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2962  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 123 aa  177  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.330049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4061  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000816625  hitchhiker  0.00000101857 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4695  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00310742  unclonable  0.0000000329491 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4465  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0195  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00503179  hitchhiker  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0165  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000589821  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0191  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  177  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00539976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0271  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  176  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.377555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0981  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 123 aa  176  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.808535  normal  0.0659851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3764  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  176  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000216882  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0194  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 124 aa  176  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00424917  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0753  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  176  9e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.263568 
 
 
-
 
NC_004310  BR1238  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.594133  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0661  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000291952  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1201  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.449722  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0693  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000127901  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0239  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.981172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1327  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139307  normal  0.0632073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1425  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 123 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469141  normal  0.0235591 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0048  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 126 aa  175  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042248  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3448  30S ribosomal protein S12  65.69 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273463  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1950  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4322  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00668981  unclonable  0.000000000093676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2693  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.315059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2727  30S ribosomal protein S12  67.14 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000304201  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3327  30S ribosomal protein S12  67.65 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.716206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0143  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000877595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1951  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  175  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000165732  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  66.43 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 		 125 aa  175  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2731  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 123 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0153  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00144977  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3343  30S ribosomal protein S12  67.15 
 
 		 125 aa  174  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00659827  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2637  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.419489  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1856  30S ribosomal protein S12  67.63 
 
 		 137 aa  174  4e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  65.71 
 
 		 136 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0575  30S ribosomal protein S12  65.44 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0045  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000913228  hitchhiker  7.76086e-21 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3473  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0860232  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1919  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000102606  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0179  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 124 aa  174  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00020988  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3174  30S ribosomal protein S12  66.18 
 
 		 126 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00103484  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3861  30S ribosomal protein S12  64.96 
 
 		 125 aa  174  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3185  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 125 aa  173  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0661629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 		 124 aa  173  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2695  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 		 124 aa  173  7e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.281072 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2982  30S ribosomal protein S12  66.42 
 
 		 124 aa  173  7e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.80538  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3672  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  172  9e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3189  30S ribosomal protein S12  66.91 
 
 		 123 aa  172  9e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.863233 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>