More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0264 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0264  RNA methyltransferase, TrmH family  100 
 
 
172 aa  354  2.9999999999999997e-97  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.194384  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0364  RNA methyltransferase  46.43 
 
 
181 aa  142  2e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0637729  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1391  RNA methyltransferase  42.5 
 
 
156 aa  131  5e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0313  rRNA methyltransferase, TrmH family  42.86 
 
 
169 aa  130  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000102446  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1909  RNA methyltransferase  42.5 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0507641  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09600  predicted rRNA methylase SpoU family  39.35 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000307354  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1943  RNA methyltransferase  42.5 
 
 
156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.158878  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0580  RNA methyltransferase  42.94 
 
 
169 aa  125  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl374  rRNA methyltransferase  41.42 
 
 
179 aa  124  7e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000924245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0432  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  41.61 
 
 
152 aa  120  7e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.112018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0602  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.863015  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0516  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0459  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.172229  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0455  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0470  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0547  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0694927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0548  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.67047e-31 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0462  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0623  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0584  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0127  RNA methyltransferase  39.41 
 
 
164 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00636988  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4754  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  39.13 
 
 
162 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0101258  hitchhiker  0.00000000000898658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2405  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  40.65 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000095272  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11010  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  42.86 
 
 
162 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0271045  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1588  RNA methyltransferase  39.13 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000775856  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf364  SpoU class tRNA/rRNA methyltransferase  36.84 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000276139  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0658  rRNA methylase (SpoU class)  41.61 
 
 
170 aa  115  3.9999999999999997e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000212975  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1370  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  37.89 
 
 
157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2332  RNA methyltransferase  39.75 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0505  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  38.51 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1346  rRNA methylase (SpoU class)  39.38 
 
 
209 aa  112  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0152  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.13 
 
 
166 aa  111  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1605  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  41.51 
 
 
153 aa  110  6e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1880  RNA methyltransferase TrmH, group 2  38.41 
 
 
155 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000892134  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0541  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.75 
 
 
152 aa  108  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.854981 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1155  rRNA methylase (SpoU class)  39.39 
 
 
168 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0200534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4812  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  39.63 
 
 
157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799981  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2107  rRNA methylase (SpoU class)  39.13 
 
 
152 aa  108  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0805  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  37.89 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.309509 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1700  RNA methyltransferase  40.12 
 
 
152 aa  106  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.295449  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0194  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.88 
 
 
156 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.141115  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2417  hypothetical protein  38.75 
 
 
149 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0823  tRNA/rRNA methyltransferase  40.13 
 
 
162 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2278  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.75 
 
 
164 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.117934  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0552  RNA methyltransferase  37.89 
 
 
157 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.242542  normal  0.84663 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1323  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.02 
 
 
156 aa  104  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.431138  normal  0.429518 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1268  rRNA methylase (SpoU class)  35.37 
 
 
169 aa  103  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000665769  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0467  23S rRNA methyltransferase  39.51 
 
 
152 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2133  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  40.61 
 
 
154 aa  103  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0138  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  39.74 
 
 
153 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147773  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2563  hypothetical protein  37.74 
 
 
149 aa  101  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3280  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  34.97 
 
 
157 aa  101  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1308  rRNA methylase-like protein cspR  36.42 
 
 
153 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0265  RNA methyltransferase  38.75 
 
 
154 aa  100  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.13438  normal  0.0255655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0012  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.34 
 
 
153 aa  100  9e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.121067  normal  0.063625 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1629  tRNA/rRNA methyltransferase  38.01 
 
 
161 aa  100  9e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1518  RNA methyltransferase  36.42 
 
 
153 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0990  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  38.36 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4081  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.27 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4019  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.27 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.921331  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3912  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  38.22 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0129  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.27 
 
 
157 aa  99.8  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.253397  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4242  RNA methyltransferase  34.57 
 
 
154 aa  99  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.175929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0211  RNA methyltransferase  37.2 
 
 
154 aa  99  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000450191  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1222  tRNA/rRNA methyltransferase  36.05 
 
 
186 aa  99  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000181503  normal  0.0200658 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0075  RNA methyltransferase  36.47 
 
 
162 aa  99  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0081  RNA methyltransferase  36.47 
 
 
162 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4135  RNA methyltransferase  36.47 
 
 
162 aa  99  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438164  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4881  RNA methyltransferase TrmH, group 2  36.02 
 
 
151 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0337  RNA methyltransferase TrmH, group 2  34.38 
 
 
151 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.296895  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0213  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  37.2 
 
 
154 aa  98.6  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.653568  normal  0.505987 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3896  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.58 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.282741 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0078  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.54 
 
 
151 aa  98.6  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3974  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  37.58 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.818121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0310  RNA methyltransferase TrmH, group 2  32.92 
 
 
156 aa  98.2  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67710  putative rRNA methylase  35.4 
 
 
153 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000281538  normal  0.793348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0052  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  37.5 
 
 
154 aa  97.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5323  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  36.02 
 
 
151 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4126  RNA methyltransferase  36.59 
 
 
154 aa  97.4  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00837599  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04710  RNA methyltransferase TrmH, group 2  34.78 
 
 
153 aa  97.4  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1049  RNA methyltransferase  33.95 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.432365  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5861  putative rRNA methylase  34.78 
 
 
153 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0279492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2851  RNA methyltransferase  33.12 
 
 
172 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3440  RNA methyltransferase TrmH, group 2  37.27 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03464  predicted rRNA methylase  35.98 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0102  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  35.98 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0763  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  37.89 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.635512  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1170  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  35.47 
 
 
186 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000414692  hitchhiker  0.000503269 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03415  hypothetical protein  35.98 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2573  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  33.33 
 
 
153 aa  96.3  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3818  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  35.98 
 
 
157 aa  95.9  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0272  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  36.08 
 
 
148 aa  95.9  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4979  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  35.98 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2862  RNA methyltransferase  33.12 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.427649 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6180  RNA methyltransferase TrmH, group 2  33.12 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4110  putative tRNA/rRNA methyltransferase YibK  35.98 
 
 
157 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0540  RNA methyltransferase, TrmH family, group 2  33.12 
 
 
156 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699614  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3185  putative tRNA/rRNA methyltransferase protein  30.43 
 
 
161 aa  95.5  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0163  tRNA/rRNA methyltransferase (SpoU)  34.59 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2906  RNA methyltransferase  32.5 
 
 
170 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>