More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1082 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1082  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  100 
 
 
337 aa  654    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.524281  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1898  NADH dehydrogenase subunit H  42.06 
 
 
352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0180885  normal  0.286914 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0303  NADH dehydrogenase subunit H  40.96 
 
 
361 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.594505 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1301  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  38.3 
 
 
352 aa  242  5e-63  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0328  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.45 
 
 
320 aa  227  2e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1633  NADH dehydrogenase subunit H  41.77 
 
 
350 aa  225  9e-58  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2048  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  42.14 
 
 
324 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.110372 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2275  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  39.32 
 
 
323 aa  215  9e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0754968  normal  0.291328 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0515  NADH dehydrogenase subunit H  41.59 
 
 
341 aa  209  4e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0658  NADH dehydrogenase subunit H  40.57 
 
 
349 aa  208  1e-52  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1793  NADH dehydrogenase (quinone)  41.67 
 
 
320 aa  203  3e-51  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.096157  normal  0.688521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0646  NADH dehydrogenase subunit H  41.82 
 
 
343 aa  202  6e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.411826  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0280  NADH dehydrogenase  33.62 
 
 
432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000247954 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0811  NADH dehydrogenase (quinone)  35.45 
 
 
353 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_798  NADH:quinone oxidoreductase subunit 1 (chain H)  34.88 
 
 
353 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0927  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  34.45 
 
 
353 aa  176  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0981  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.78 
 
 
348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0203  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.07 
 
 
329 aa  172  6.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.746542  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  34.74 
 
 
344 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1626  NADH dehydrogenase (quinone)  31.23 
 
 
440 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0675277 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1209  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  32.32 
 
 
349 aa  168  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000168928  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1661  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 
322 aa  166  4e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3409  NADH dehydrogenase subunit H  36 
 
 
333 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3815  NADH dehydrogenase subunit H  35.79 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  34.69 
 
 
341 aa  162  5.0000000000000005e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4978  NADH dehydrogenase subunit H  33.89 
 
 
333 aa  162  7e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.89 
 
 
366 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  32.22 
 
 
372 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.742296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5472  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5421  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5146  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4996  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5387  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14052e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5533  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0101965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5538  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5094  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5417  NADH dehydrogenase subunit H  33.56 
 
 
333 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0274  NADH dehydrogenase subunit H  35.22 
 
 
451 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1666  NADH dehydrogenase subunit H  32.49 
 
 
372 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1527  NADH dehydrogenase subunit H  31.61 
 
 
372 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.732572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3297  NADH dehydrogenase subunit H  36.25 
 
 
333 aa  159  8e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  33.76 
 
 
341 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  34.98 
 
 
352 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  33.76 
 
 
341 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2042  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.11 
 
 
349 aa  158  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268939  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02331  NADH dehydrogenase subunit H  31.61 
 
 
372 aa  158  2e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.896857  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0318  NADH dehydrogenase  34.74 
 
 
317 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.38198 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0638  NADH dehydrogenase I chain H  32.63 
 
 
372 aa  157  3e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01891  NADH dehydrogenase subunit H  31 
 
 
372 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.56 
 
 
343 aa  157  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0848  NADH dehydrogenase (quinone)  34.91 
 
 
322 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000000126936  hitchhiker  0.00000000866182 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  33.55 
 
 
354 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  33.77 
 
 
355 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1276  NADH dehydrogenase (quinone)  35 
 
 
415 aa  156  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.815883  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  33.77 
 
 
355 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  33.77 
 
 
355 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0747  NADH dehydrogenase I chain H  32.46 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.200142  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1998  NADH dehydrogenase subunit H  34.3 
 
 
345 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.222188  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1579  NADH dehydrogenase subunit H  33.13 
 
 
372 aa  156  5.0000000000000005e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.181564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  32.55 
 
 
347 aa  156  6e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0345  NADH dehydrogenase I, H subunit  33.33 
 
 
348 aa  155  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  33.44 
 
 
355 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01771  NADH dehydrogenase subunit H  31.61 
 
 
384 aa  155  7e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0970603  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2620  NADH:ubiquinone oxidoreductase chain H  32.55 
 
 
365 aa  155  7e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.146447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0666  NADH dehydrogenase (quinone)  34.77 
 
 
317 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.471376  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  33.55 
 
 
354 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  33.01 
 
 
333 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  31.82 
 
 
358 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  33.01 
 
 
352 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  33.55 
 
 
354 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  33.01 
 
 
352 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  33.01 
 
 
352 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  33.55 
 
 
354 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26911  NADH dehydrogenase subunit H  31.61 
 
 
384 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2529  NADH dehydrogenase subunit H  32.81 
 
 
372 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3348  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.86 
 
 
337 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22967  normal  0.216817 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  33.77 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  33.77 
 
 
355 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0210  NADH dehydrogenase I chain H  35.13 
 
 
330 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1343  NADH dehydrogenase subunit H  31.21 
 
 
372 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1039  NADH dehydrogenase subunit H  32.5 
 
 
372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000216191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  30.94 
 
 
360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1010  NADH dehydrogenase subunit H  32.5 
 
 
372 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  34.19 
 
 
358 aa  153  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  33.66 
 
 
358 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  31.41 
 
 
354 aa  153  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  31.92 
 
 
354 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  31.92 
 
 
354 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  33.66 
 
 
340 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  34.15 
 
 
338 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1869  NADH dehydrogenase (quinone)  31.63 
 
 
372 aa  153  5e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  33.44 
 
 
349 aa  153  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  33.66 
 
 
340 aa  153  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  33.33 
 
 
357 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2522  NADH dehydrogenase subunit H  34.73 
 
 
345 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1184  NADH dehydrogenase subunit H  34.73 
 
 
341 aa  152  7e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.503975  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  30.94 
 
 
354 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1293  F420H2 dehydrogenase subunit H  34.67 
 
 
344 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000183992  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2443  NADH dehydrogenase (quinone)  31.41 
 
 
360 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  31.54 
 
 
359 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>