50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3499 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  100 
 
 		 305 aa  596  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  56.48 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  45.82 
 
 		 326 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  45 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  38.02 
 
 		 318 aa  192  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  42.99 
 
 		 315 aa  182  6e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  31.41 
 
 		 311 aa  178  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  40 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  39.81 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  39.14 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  29.33 
 
 		 392 aa  97.1  3e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  28.13 
 
 		 371 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  29.83 
 
 		 373 aa  95.1  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  27.64 
 
 		 364 aa  90.1  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  25.82 
 
 		 378 aa  72.4  0.000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  27.41 
 
 		 347 aa  71.2  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  28.71 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  28.74 
 
 		 426 aa  62  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  29.24 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  26.42 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  29.14 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  24.92 
 
 		 360 aa  55.8  0.0000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  24 
 
 		 382 aa  50.4  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  31.25 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0652  FAD dependent oxidoreductase  31.69 
 
 		 365 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.139028  normal  0.321624 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  26.74 
 
 		 361 aa  49.3  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  29.17 
 
 		 371 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  26.33 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  26.48 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  30 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0612  FAD dependent oxidoreductase  33.1 
 
 		 365 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 		 430 aa  47  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  46.3 
 
 		 404 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43271  predicted protein  25.9 
 
 		 332 aa  46.2  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0658  FAD dependent oxidoreductase  32.41 
 
 		 365 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  28 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4841  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 366 aa  43.9  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.388467  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0912  glycine oxidase ThiO  33.74 
 
 		 349 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.970325  normal  0.149805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 412 aa  44.3  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  29.61 
 
 		 406 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  43.24 
 
 		 368 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0817  oxidoreductase, FAD-binding protein  36.08 
 
 		 367 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 396 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  26.17 
 
 		 413 aa  42.4  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>