16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4743 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
382 aa  799    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 
390 aa  242  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  41.03 
 
 
396 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  38.44 
 
 
404 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
273 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  24.91 
 
 
320 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  25.24 
 
 
318 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  23.99 
 
 
326 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  44.26 
 
 
364 aa  57.4  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  24.81 
 
 
311 aa  53.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  24.64 
 
 
315 aa  52.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  24 
 
 
305 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  38.16 
 
 
426 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  41.38 
 
 
347 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  40.32 
 
 
310 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  24.64 
 
 
310 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>