13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03030 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  100 
 
 
404 aa  821    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  50.98 
 
 
390 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  49.03 
 
 
396 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  36.1 
 
 
382 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 
273 aa  95.5  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  62.22 
 
 
364 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  59.46 
 
 
320 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  25.45 
 
 
347 aa  50.8  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  46 
 
 
426 aa  46.6  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  52.27 
 
 
318 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  46.3 
 
 
305 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  33.33 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  24.78 
 
 
311 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>