52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_09913 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  100 
 
 
311 aa  648    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  34.21 
 
 
326 aa  193  3e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  31.41 
 
 
305 aa  178  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  32.12 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  31.75 
 
 
320 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  32.58 
 
 
318 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  31.77 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  30.03 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  31.35 
 
 
320 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  30.39 
 
 
310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 
273 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  26.63 
 
 
364 aa  97.8  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  25.07 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  24.7 
 
 
347 aa  77.4  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  24.27 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  25 
 
 
373 aa  72  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
426 aa  70.1  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3748  glycine oxidase ThiO  23.49 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  26.3 
 
 
348 aa  68.6  0.0000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  29.28 
 
 
396 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  27.91 
 
 
360 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  24.02 
 
 
378 aa  58.5  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.2 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  25.16 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  21.82 
 
 
368 aa  56.6  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  24.84 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 
390 aa  53.9  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 
382 aa  53.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  26.03 
 
 
338 aa  53.1  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2569  oxidoreductase, DadA family  21.69 
 
 
371 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0599885 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  23.77 
 
 
334 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2732  oxidoreductase, DadA family  21.41 
 
 
371 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2742  DadA family oxidoreductase  21.41 
 
 
371 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00153462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2430  FAD dependent oxidoreductase  21.69 
 
 
371 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0834847  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  25.73 
 
 
338 aa  51.2  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2489  D-amino acid dehydrogenase, small subunit  21.69 
 
 
371 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000926626  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  23.82 
 
 
338 aa  49.7  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2777  oxidoreductase, DadA family  21.13 
 
 
371 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.848486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  22.16 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  22.37 
 
 
338 aa  47  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2454  D-amino acid dehydrogenase small subunit  20.85 
 
 
371 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2715  DadA family oxidoreductase  21.69 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2529  DadA family oxidoreductase  21.69 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0933493  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2728  oxidoreductase, DadA family  21.69 
 
 
371 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000981681 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3842  D-amino acid dehydrogenase small subunit  31.86 
 
 
418 aa  45.4  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  22.68 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1848  FAD dependent oxidoreductase  20.56 
 
 
373 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.344381  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2001  D-amino-acid dehydrogenase  26.74 
 
 
416 aa  44.3  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.930793 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  26.45 
 
 
264 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  24.78 
 
 
404 aa  43.5  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  54.55 
 
 
422 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  23.43 
 
 
369 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>