36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE00330 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  757    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  49.62 
 
 
392 aa  354  1e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  31.71 
 
 
364 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  28.65 
 
 
348 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  29.07 
 
 
347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  29.02 
 
 
378 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  30.38 
 
 
360 aa  116  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  34 
 
 
326 aa  115  8.999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  30.11 
 
 
305 aa  97.4  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  28.88 
 
 
315 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  31.46 
 
 
264 aa  88.2  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  29.46 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  29.75 
 
 
310 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  30 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  26.72 
 
 
320 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  25 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  25.77 
 
 
426 aa  73.2  0.000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  28.95 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 
273 aa  63.2  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  26.38 
 
 
306 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  23.32 
 
 
375 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0787  glycine oxidase ThiO  23.56 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.564699  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4544  glycine oxidase ThiO  23.26 
 
 
369 aa  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.569361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 
375 aa  50.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0884  glycine oxidase ThiO  23.15 
 
 
369 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00117191  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  22.68 
 
 
375 aa  50.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0800  glycine oxidase  22.85 
 
 
369 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  22.48 
 
 
371 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0696  glycine oxidase  24.09 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0730  glycine oxidase  24.09 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0640  glycine oxidase  23.15 
 
 
369 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 
375 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
375 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  27.84 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2172  FAD dependent oxidoreductase  23.58 
 
 
380 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>