16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3194 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 390 aa  782    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  56.38 
 
 		 396 aa  378  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  50.98 
 
 		 404 aa  334  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 		 382 aa  243  6e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  32.61 
 
 		 273 aa  113  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  37.89 
 
 		 310 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  58 
 
 		 364 aa  55.8  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  25.68 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  26.35 
 
 		 305 aa  50.4  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  55.81 
 
 		 320 aa  49.7  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  27.16 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  40.58 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  32.56 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  47.92 
 
 		 426 aa  45.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  40.74 
 
 		 371 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0276149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  50 
 
 		 310 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>