36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1168 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1168  D-aspartate oxidase  100 
 
 
318 aa  645    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11934  D-amino acid oxidase aao  44.19 
 
 
320 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0526  D-amino acid oxidase  44.78 
 
 
326 aa  227  2e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000920069  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3499  D-amino-acid oxidase  38.02 
 
 
305 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_5336  predicted protein  37.17 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00372413  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1780  D-amino-acid oxidase  42.86 
 
 
310 aa  171  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.763397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3505  D-aspartate oxidase  37.79 
 
 
306 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09913  putative D-amino acid oxidase  32.58 
 
 
311 aa  156  4e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.196189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4180  D-aspartate oxidase  36.66 
 
 
315 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.251055  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4657  D-aspartate oxidase  34.29 
 
 
320 aa  138  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.29884  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83340  d-amino acid oxidase  28.18 
 
 
378 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8818  D-aspartate oxidase  29.66 
 
 
371 aa  102  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0276149 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10863  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_5G13940)  29.2 
 
 
347 aa  100  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00174  D-amino acid oxidase (AFU_orthologue; AFUA_5G11290)  27.07 
 
 
364 aa  99.8  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3809  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 
273 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00330  conserved hypothetical protein  30 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00932753  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00410  conserved hypothetical protein  26.07 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01770  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 
426 aa  70.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4743  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 
382 aa  67  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.285459 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33517  D-aspartate oxidase  24.65 
 
 
348 aa  64.7  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57912  D-amino acid oxidase  23.82 
 
 
360 aa  60.5  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.687293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4744  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 
396 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732215  hitchhiker  0.0052696 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07187  FAD dependent oxidoreductase superfamily (AFU_orthologue; AFUA_6G10230)  25.14 
 
 
264 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3194  FAD dependent oxidoreductase  27.16 
 
 
390 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.329567  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  28.28 
 
 
338 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0801  glycine oxidase ThiO  24.19 
 
 
367 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  67.57 
 
 
506 aa  46.6  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3977  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 
377 aa  46.6  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03030  D-amino acid oxidase  52.27 
 
 
404 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43271  predicted protein  23.2 
 
 
332 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0494  glycine oxidase ThiO  26.11 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5037  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.484973 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3227  FAD dependent oxidoreductase  32.85 
 
 
430 aa  43.9  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  25.85 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5266  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
427 aa  43.1  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600372  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3358  oxidoreductase  29.37 
 
 
417 aa  42.4  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>