33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3094 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3094  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  287  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0258  Domain of unknown function DUF1905  43.61 
 
 		 148 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6953  hypothetical protein  40.15 
 
 		 150 aa  95.1  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.487611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1963  hypothetical protein  43.61 
 
 		 149 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0905021  hitchhiker  0.0000327223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2073  hypothetical protein  38.52 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361732  normal  0.0635698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0865  hypothetical protein  32.19 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0330  hypothetical protein  31.88 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2113  hypothetical protein  27.68 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1487  hypothetical protein  28.12 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.702863  normal  0.552132 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4564  hypothetical protein  30.85 
 
 		 171 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.254825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4567  hypothetical protein  48.33 
 
 		 190 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.537522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  40.98 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0041  hypothetical protein  41.54 
 
 		 206 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00622205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0021  hypothetical protein  32 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.104538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2906  hypothetical protein  28.28 
 
 		 171 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000157084 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1217  hypothetical protein  31.17 
 
 		 208 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2578  hypothetical protein  27.41 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.604019  normal  0.277683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  33.87 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08436  hypothetical protein  44.68 
 
 		 202 aa  43.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0070  hypothetical protein  28.26 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.333533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0851  hypothetical protein  40.62 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1580  hypothetical protein  32.81 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0912929  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  37.88 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3068  hypothetical protein  32.5 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0120181 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2525  hypothetical protein  27.94 
 
 		 199 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000267669  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2476  hypothetical protein  27.94 
 
 		 199 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000134099  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  38.71 
 
 		 190 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3686  hypothetical protein  39.06 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2380  hypothetical protein  31.25 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.419898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0903  hypothetical protein  40 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3908  hypothetical protein  37.5 
 
 		 194 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31569  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4664  hypothetical protein  40.62 
 
 		 196 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3065  hypothetical protein  44.83 
 
 		 219 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>