266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2734 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2734  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2490  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  54.76 
 
 
277 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2990  putative adenylate/guanylate cyclase  37.65 
 
 
275 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.67963  normal  0.0157257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2975  adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
333 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.931348  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3019  putative adenylate/guanylate cyclase  37.25 
 
 
333 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3321  putative adenylate/guanylate cyclase  40.89 
 
 
270 aa  132  6e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.34656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3535  putative adenylate/guanylate cyclase  36.88 
 
 
301 aa  129  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.112052  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11664  hypothetical protein  33.79 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.77538 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0795  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
449 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0810  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
449 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190298  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0790  putative adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
449 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  30.65 
 
 
1160 aa  66.6  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3937  adenylate/guanylate cyclase  28.77 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3831  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.29 
 
 
643 aa  66.2  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1514  putative adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
279 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.65 
 
 
584 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  30.11 
 
 
584 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  32.65 
 
 
1122 aa  63.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1071  adenylate/guanylate cyclase  34.16 
 
 
680 aa  62.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.212449  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1543  adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424876  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1328  Adenylate cyclase  35.61 
 
 
330 aa  62.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1566  putative adenylate/guanylate cyclase  32.93 
 
 
279 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0921  adenylate/guanylate cyclase  33.58 
 
 
306 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.943897  normal  0.261111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4126  adenylate/guanylate cyclase  31.5 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.893274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28590  family 3 adenylate cyclase  29.35 
 
 
346 aa  61.2  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.19264 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08360  family 3 adenylate cyclase  36.59 
 
 
404 aa  61.2  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0872252  normal  0.0837109 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0852  adenylate/guanylate cyclase  33.07 
 
 
350 aa  60.8  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000040667  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  25 
 
 
441 aa  60.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2552  adenylate cyclase  30.06 
 
 
336 aa  59.7  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.564611  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1307  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
320 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.383472  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0704  adenylate/guanylate cyclase  28.49 
 
 
337 aa  59.3  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1652  adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 
275 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.225182  normal  0.0809005 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  24.44 
 
 
431 aa  58.9  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2267  putative adenylate/guanylate cyclase  30.67 
 
 
703 aa  58.9  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1154  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
364 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  24.06 
 
 
460 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0217  adenylate/guanylate cyclase  30.88 
 
 
357 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000694787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0078  adenylate/guanylate cyclase  32.16 
 
 
471 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.294245  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11929  lignin peroxidase lipJ  31.87 
 
 
462 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.831009  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1901  adenylate/guanylate cyclase  29.7 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500403  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6225  putative adenylate/guanylate cyclase  32.17 
 
 
532 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  31.54 
 
 
431 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.08 
 
 
614 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  23.89 
 
 
735 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4534  putative adenylate/guanylate cyclase  30.13 
 
 
425 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  29.63 
 
 
638 aa  56.6  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.77 
 
 
1226 aa  56.6  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.17 
 
 
611 aa  56.2  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05920  family 3 adenylate cyclase  29.5 
 
 
379 aa  56.2  0.0000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0164  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.58 
 
 
371 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0205  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  27.17 
 
 
354 aa  54.7  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00287203  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4144  forkhead-associated  31.34 
 
 
299 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.622359  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2451  putative adenylate/guanylate cyclase  29.2 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.198079  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.85 
 
 
701 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2512  putative adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
327 aa  54.3  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  25.27 
 
 
643 aa  54.3  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  25.35 
 
 
421 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0817  adenylate/guanylate cyclase  30.17 
 
 
435 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5395  putative adenylate/guanylate cyclase  34.75 
 
 
532 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0939703 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2799  putative adenylate/guanylate cyclase  29.05 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  26.67 
 
 
1037 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4506  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.02 
 
 
332 aa  53.9  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.183057  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6439  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 
664 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.663004  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 
464 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2563  adenylate/guanylate cyclase  27.38 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3492  adenylate cyclase  27.11 
 
 
335 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3418  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.41 
 
 
595 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.565429  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  34.04 
 
 
549 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 
469 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0031  adenylate/guanylate cyclase  30.53 
 
 
633 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4165  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
357 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
1094 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4130  adenylate/guanylate cyclase  29.63 
 
 
348 aa  52.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  23.2 
 
 
1207 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
665 aa  52  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1135  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
597 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.449493  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6414  adenylate cyclase  24.23 
 
 
395 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0293466  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3146  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.59 
 
 
598 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
528 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
528 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  34.58 
 
 
1141 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21100  family 3 adenylate cyclase  30.83 
 
 
400 aa  51.6  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0689406  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 
528 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
1142 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1023  adenylate/guanylate cyclase  31.54 
 
 
345 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2284  putative adenylate/guanylate cyclase  32.23 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2315  adenylate/guanylate cyclase  29.41 
 
 
667 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  30.5 
 
 
464 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1994  putative adenylate/guanylate cyclase  28.86 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  0.377958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2558  adenylate/guanylate cyclase  28.68 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.323769  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  26.32 
 
 
1156 aa  50.4  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.17 
 
 
637 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1329  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000195164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  29.14 
 
 
437 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
586 aa  50.4  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0150  adenylate/guanylate cyclase  30.57 
 
 
334 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2091  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
263 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.832203  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  27.08 
 
 
348 aa  50.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1395  putative adenylate/guanylate cyclase  33.1 
 
 
536 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.966002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3346  adenylate/guanylate cyclase  29.23 
 
 
1392 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0911306  normal  0.84372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>