More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0146 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 211 aa  417  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  51.22 
 
 		 225 aa  192  4e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  48.13 
 
 		 232 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  47.06 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  47.91 
 
 		 228 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  47.91 
 
 		 228 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  47.91 
 
 		 228 aa  171  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  47.51 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  44.67 
 
 		 203 aa  135  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  44.39 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  39.8 
 
 		 202 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  38 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  38.73 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 		 259 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 220 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 215 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 443 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  30.68 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.28 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.22 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.99 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.96 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  29.59 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  29.59 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.49 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.32 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  24.71 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  24.04 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  36.32 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  24.71 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  24.12 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  25.29 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  25.29 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25.73 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4039  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  27.27 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  28.4 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  28.88 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  31.07 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.85 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.85 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.85 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  24.55 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  31.5 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.47 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  25.73 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>