70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1410 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1410  ComEC/Rec2-related protein  100 
 
 		 404 aa  768    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0315554  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0733  ComEC/Rec2-related protein  32.9 
 
 		 400 aa  183  5.0000000000000004e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00014366  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1063  ComEC/Rec2-related protein  31.53 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000246434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1049  ComEC/Rec2-related protein  29.43 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0473085  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0243  ComEC/Rec2-related protein  26.25 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2092  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.41 
 
 		 757 aa  63.5  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000797686  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10250  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.77 
 
 		 734 aa  58.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.215433  hitchhiker  0.0000000811582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3093  ComEC/Rec2-related protein  23.86 
 
 		 671 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.662312  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_23  DNA internalization competence protein  31.03 
 
 		 795 aa  55.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0107142  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1996  putative competence protein  25.23 
 
 		 684 aa  55.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0023  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  30.17 
 
 		 796 aa  54.7  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01534  hypothetical protein  31.97 
 
 		 752 aa  54.3  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1656  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.05 
 
 		 781 aa  53.5  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.754434  hitchhiker  0.00232522 
 
 
-
 
NC_002936  DET0024  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.31 
 
 		 795 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0591884  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1160  ComEC/Rec2 family protein  24.91 
 
 		 720 aa  53.1  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4370  ComEC/Rec2-related protein  25.28 
 
 		 757 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.754467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1186  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.93 
 
 		 722 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.41344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0899  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  27.23 
 
 		 798 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.383263  normal  0.740662 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1470  ComEC/Rec2-related protein  25.93 
 
 		 609 aa  50.8  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2016  comC competence related protein, putative  25 
 
 		 551 aa  50.8  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0706  ComEC/Rec2-related protein  24.06 
 
 		 684 aa  50.4  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.471107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1134  ComEC/Rec2-related protein  26.85 
 
 		 672 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2515  ComEC/Rec2-related protein  34.17 
 
 		 531 aa  50.4  0.00006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00025028  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1270  ComEC/Rec2-related protein  29.05 
 
 		 439 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1981  ComEC/Rec2-related protein  25.6 
 
 		 710 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512904 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf372  hypothetical protein  29.08 
 
 		 459 aa  49.3  0.0001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000246539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2301  competence family protein  24.79 
 
 		 551 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0435  ComEC/Rec2-related protein  26.23 
 
 		 674 aa  49.3  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12920  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.82 
 
 		 775 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000012809  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0813  ComEC/Rec2-related protein  26.25 
 
 		 591 aa  47.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.56111  hitchhiker  0.00293052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1048  hypothetical protein  20.85 
 
 		 737 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.486822 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1097  hypothetical protein  21.24 
 
 		 756 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1843  ComEC/Rec2-related protein  27.82 
 
 		 706 aa  47.8  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.151379  normal  0.0423883 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1016  hypothetical protein  20.85 
 
 		 737 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.619127  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04815  competence protein  30.77 
 
 		 679 aa  47.4  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1081  hypothetical protein  20.85 
 
 		 737 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.30814  normal  0.0474337 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0989  hypothetical protein  21.24 
 
 		 737 aa  47.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1990  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.66 
 
 		 835 aa  47.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1637  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.17 
 
 		 761 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.594703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0317  ComEC/Rec2 family protein  28.46 
 
 		 736 aa  46.6  0.0009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00924  hypothetical protein  21.19 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.630751  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2730  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  21.19 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.170872  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00917  conserved inner membrane protein  21.19 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.578469  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1602  ComEC/Rec2-related protein  24.81 
 
 		 739 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.196969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1397  ComEC/Rec2-related protein  26.45 
 
 		 702 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2683  hypothetical protein  21.19 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.692344  normal  0.226957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1336  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.3 
 
 		 765 aa  45.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.62013 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2474  ComEC/Rec2-related protein  22.15 
 
 		 879 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.672876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1070  ComEC/Rec2-related protein  25.34 
 
 		 593 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.928875  normal  0.121556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3836  ComEC/Rec2-related protein  24.9 
 
 		 769 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1074  hypothetical protein  21.32 
 
 		 754 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.361238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1885  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  25.9 
 
 		 797 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.372915  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2663  ComEC/Rec2-related protein  19.85 
 
 		 489 aa  44.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.23872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  24.04 
 
 		 841 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0601  competence protein  24.81 
 
 		 757 aa  44.7  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.427336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3051  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.36 
 
 		 780 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.755952  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1595  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.58 
 
 		 761 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2449  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.03 
 
 		 759 aa  44.3  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.327807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2785  ComEC/Rec2-related protein  25.6 
 
 		 726 aa  43.9  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.457375  hitchhiker  0.00294021 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0450  hypothetical protein  26.8 
 
 		 706 aa  43.9  0.005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.778093 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3048  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  29.57 
 
 		 679 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1011  hypothetical protein  20.9 
 
 		 754 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00460048  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0604  putative competence locus E  27.39 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.790814  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1769  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.5 
 
 		 812 aa  43.9  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2973  competence protein  26.57 
 
 		 626 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.530414  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2030  ComEC/Rec2-related protein  24.24 
 
 		 760 aa  43.5  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1921  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  22.74 
 
 		 752 aa  43.5  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00848355  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1957  DNA internalization-related competence protein ComEC/Rec2  26.98 
 
 		 896 aa  43.1  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.398529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0687  ComEC/Rec2-related protein  23.66 
 
 		 781 aa  42.7  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.236524 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1470  ComEC/rec2 family protein  25.89 
 
 		 752 aa  42.7  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>