98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1301 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1301  ATPase  100 
 
 
328 aa  656    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.777797  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1462  ATPase  63.91 
 
 
352 aa  442  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1850  ATPase  59.45 
 
 
351 aa  422  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1812  ATPase  59.15 
 
 
351 aa  421  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1448  ATPase  56.85 
 
 
360 aa  385  1e-106  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.440303  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0934  ATPase  39.24 
 
 
302 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3359  hypothetical protein  27.16 
 
 
353 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0051  hypothetical protein  30.03 
 
 
353 aa  117  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.49777 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0637  hypothetical protein  29.07 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.261889  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1363  hypothetical protein  28.89 
 
 
353 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2042  AAA ATPase  30.61 
 
 
396 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0306993  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0623  hypothetical protein  28.68 
 
 
371 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00147327  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2921  hypothetical protein  28.89 
 
 
353 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.772953 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0483  ATPase  30.04 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0522  AAA family ATPase  33 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.010453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1600  MoxR-like ATPase  32.47 
 
 
332 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0805  hypothetical protein  28.4 
 
 
355 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1490  AAA_3 ATPase  26.64 
 
 
364 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0748  hypothetical protein  27.36 
 
 
347 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6512  ATPase  29.53 
 
 
342 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2040  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  31.6 
 
 
364 aa  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0628555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1928  MoxR-like protein ATPase-like protein  26.34 
 
 
353 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3122  hypothetical protein  30.1 
 
 
387 aa  102  6e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2286  hypothetical protein  35.83 
 
 
348 aa  103  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2964  hypothetical protein  29.05 
 
 
348 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2569  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.77 
 
 
327 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0872  ATPase  30.32 
 
 
340 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.571105  normal  0.718721 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1782  ATPase  30.8 
 
 
331 aa  102  1e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.860256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1120  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  27.4 
 
 
354 aa  101  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1546  hypothetical protein  29.36 
 
 
379 aa  99  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.776475 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0475  ATPase  27.24 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1784  ATPase  27.23 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0152  P-loop ATPase  27.23 
 
 
379 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1973  hypothetical protein  27.05 
 
 
372 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0367199  normal  0.929244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1340  ATPase  27.23 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.287921  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1251  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.34 
 
 
347 aa  90.1  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1729  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  27.73 
 
 
330 aa  89.7  6e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000142331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1403  hypothetical protein  27.73 
 
 
369 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5996  hypothetical protein  29.78 
 
 
369 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1800  hypothetical protein  25.67 
 
 
381 aa  86.3  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0256  hypothetical protein  27.73 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.143072  normal  0.216525 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1319  hypothetical protein  27.18 
 
 
369 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1218  hypothetical protein  26.47 
 
 
369 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.780645 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1621  AAA ATPase  30.69 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.171391  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5262  AAA ATPase  30.69 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.786609  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5803  ATPase  25.1 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000039959 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5625  ATPase  25.1 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.486488  normal  0.318658 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5422  ATPase  25.1 
 
 
368 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1910  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  29.81 
 
 
360 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3480  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.03 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5603  ATPase  27.91 
 
 
341 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2697  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  26.53 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0249  hypothetical protein  23.3 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.211939  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2825  MoxR-like protein ATPase-like protein  31.74 
 
 
367 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2868  ATPase  31.76 
 
 
414 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.249465  normal  0.109975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1222  AAA ATPase  28.02 
 
 
505 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  30.83 
 
 
361 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.26531  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1808  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.11 
 
 
398 aa  62  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0067351  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4134  ATPase  22.88 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16090  ATPase family protein associated with various cellular activities (AAA)  25.23 
 
 
489 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.454576  hitchhiker  0.000000267923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00799  ATPase  27.13 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000387294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2494  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  23.47 
 
 
521 aa  58.9  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3321  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  30.43 
 
 
418 aa  58.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.395905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2669  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  24.6 
 
 
372 aa  55.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000749839  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2360  hypothetical protein  25.18 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.615726  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8670  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.4 
 
 
414 aa  49.3  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0965091  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1425  AAA ATPase  21.01 
 
 
362 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.113795 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  31.71 
 
 
332 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3068  ATPase, AAA family  27.01 
 
 
310 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0718148  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3478  transcriptional regulator, SARP family  28.83 
 
 
365 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2773  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  27.01 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0680478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  26.79 
 
 
303 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  28.57 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  28.57 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.57 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  28.57 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  28.57 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2942  MoxR-like ATPase  27.61 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000701608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2759  magnesium chelatase; methanol dehydrogenase regulator  26.28 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  27.68 
 
 
315 aa  45.1  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0175  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  32.26 
 
 
382 aa  44.3  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5165  ATPase  29.86 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5254  ATPase  29.86 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613328  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5546  ATPase  29.86 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1170  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  24.61 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3038  AAA family ATPase  26.28 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.392336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2824  AAA family ATPase  26.28 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0314282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3034  ATPase, AAA family  26.28 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  26.79 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3073  AAA family ATPase  26.28 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.209671  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0039  ATPase  25.73 
 
 
333 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.320822 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  26.79 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2426  ATPase  28.18 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.624284  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0313  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpA  30.77 
 
 
740 aa  43.1  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0640  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  28.35 
 
 
726 aa  43.1  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.680329  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  25.89 
 
 
303 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0042  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  28.81 
 
 
325 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3171  magnesium chelatase, ChlI subunit; methanol dehydrogenase regulator  26.87 
 
 
309 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>