More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0982 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0982  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1109  50S ribosomal protein L17  62.7 
 
 		 127 aa  162  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000625282  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1321  50S ribosomal protein L17  62.1 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000123779  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1365  50S ribosomal protein L17  62.1 
 
 		 131 aa  158  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00168985  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0761  ribosomal protein L17  51.18 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1367  ribosomal protein L17  45.6 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  43.22 
 
 		 202 aa  99.4  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 117 aa  98.6  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  42.86 
 
 		 118 aa  97.4  5e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  46.55 
 
 		 112 aa  97.8  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05855  putative 50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 156 aa  97.8  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 203 aa  97.1  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  40.94 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0870  ribosomal protein L17  45.16 
 
 		 226 aa  97.1  8e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 117 aa  95.9  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 117 aa  95.9  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2923  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 132 aa  95.9  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000719961 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  43.2 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 117 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3270  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0169  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 194 aa  95.5  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.474086 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  41.13 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  41.18 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 195 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0290  ribosomal protein L17  40.32 
 
 		 117 aa  94.7  4e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 195 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  44.92 
 
 		 195 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0208  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 172 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.162361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  42.37 
 
 		 114 aa  94  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0200  ribosomal protein L17  43.2 
 
 		 171 aa  94  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2748  ribosomal protein L17  40.8 
 
 		 138 aa  94  7e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.727707  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  43.55 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  44.83 
 
 		 112 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  40.32 
 
 		 176 aa  92  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0427  ribosomal protein L17  40 
 
 		 118 aa  92.8  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75518  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  43.7 
 
 		 219 aa  92  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  41.13 
 
 		 129 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  41.13 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  43.65 
 
 		 118 aa  91.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2230  50S ribosomal protein L17  39.2 
 
 		 162 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025919  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  44.35 
 
 		 116 aa  91.3  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  41.38 
 
 		 112 aa  91.7  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  40.34 
 
 		 190 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 130 aa  91.3  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  42.4 
 
 		 118 aa  91.3  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2036  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000459546  normal  0.304278 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0239  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00616795  unclonable  0.00000909756 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2268  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 166 aa  91.3  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0312187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 130 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  41.53 
 
 		 169 aa  90.9  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0716  ribosomal protein L17  40.68 
 
 		 202 aa  90.5  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 183 aa  90.5  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 130 aa  90.1  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2201  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 151 aa  90.1  8e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0373281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0515  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 130 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3498  ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.110108  hitchhiker  0.0000306031 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0510  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 119 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.698201  normal  0.0738691 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 129 aa  90.1  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2812  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0476754  normal  0.443503 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2615  ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.718134  normal  0.325344 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  40.68 
 
 		 190 aa  89.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  37.1 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 128 aa  90.1  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 127 aa  90.1  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  43.22 
 
 		 180 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 128 aa  89.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3041  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.490666  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0276  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0461081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0985  50S ribosomal protein L17P  41.13 
 
 		 132 aa  90.1  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.200364  hitchhiker  0.00397846 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1951  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3505  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0317  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 152 aa  89.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0814309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0370  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 163 aa  89.4  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.547464  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3777  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.393017  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  42.74 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3142  50S ribosomal protein L17  41.13 
 
 		 131 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  41.94 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>