42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3220 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3220  PilT domain-containing protein  100 
 
 		 146 aa  297  4e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0761  hypothetical protein  43.07 
 
 		 233 aa  103  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0290423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1030  hypothetical protein  37.68 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.446924 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0728  hypothetical protein  43.07 
 
 		 233 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.597207  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1731  PilT domain-containing protein  40.88 
 
 		 146 aa  103  6e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000308343  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1400  PilT protein domain protein  40.6 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000555482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0176  hypothetical protein  39.71 
 
 		 144 aa  96.7  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.185672  normal  0.939357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5522  hypothetical protein  35.46 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.435209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1631  PilT domain-containing protein  33.1 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.013688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2011  PilT protein-like  37.06 
 
 		 149 aa  87.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2532  PilT domain-containing protein  31.39 
 
 		 143 aa  83.6  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.127016  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1461  PilT-like protein  33.58 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2961  PilT protein domain protein  37.04 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.393791  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0050  PilT domain-containing protein  34.56 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1570  PilT-like protein  30.77 
 
 		 142 aa  77  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00584099  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0538  PilT protein-like  37.96 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3973  PilT protein domain protein  36.43 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1854  PilT domain-containing protein  29.93 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4037  hypothetical protein  35.07 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696248 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2888  PIN domain protein  34.04 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0769801  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2508  PilT protein domain protein  34.04 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3611  PilT domain-containing protein  32.12 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.235155  normal  0.0281309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3405  PilT-like protein  29.32 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0278877  normal  0.0155111 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4435  hypothetical protein  27.97 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0434783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2071  PilT protein domain protein  27.94 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000612015  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1369  PIN domain protein  34.78 
 
 		 259 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2976  PilT domain-containing protein  30.28 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0690747  hitchhiker  0.0000187437 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4841  hypothetical protein  28.77 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154239 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2491  PilT protein domain protein  26.62 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1166  PilT protein-like protein  37.96 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3045  PilT domain-containing protein  30.82 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000198213  normal  0.569575 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0377  PilT protein domain protein  28.67 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0279891  normal  0.0333556 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2930  PIN domain protein  45.28 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4271  PilT domain-containing protein  29.63 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0321554  normal  0.0832297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0580  PilT domain-containing protein  32.59 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1720  PilT protein-like  22.38 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4188  hypothetical protein  31.11 
 
 		 131 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3055  hypothetical protein  31.85 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.187147 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1845  hypothetical protein  32.88 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4025  hypothetical protein  31.85 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0984  PilT protein-like  30 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0595  PilT domain-containing protein  25.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>