More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2218 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2218  rhodanese domain protein  100 
 
 
118 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0630  Rhodanese domain protein  65.14 
 
 
109 aa  144  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.220757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  54.46 
 
 
109 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2558  rhodanese-like domain protein  53.21 
 
 
109 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.029677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2188  Rhodanese domain protein  53.21 
 
 
109 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0415469  hitchhiker  0.000000235552 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1906  Rhodanese domain protein  52.94 
 
 
105 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000236409  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0020  Rhodanese domain-containing protein  51.14 
 
 
119 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.529293  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0692  rhodanese domain-containing protein  48.39 
 
 
149 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  50 
 
 
130 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3285  rhodanese domain-containing protein  44.32 
 
 
141 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  39.39 
 
 
269 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  39 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  36.27 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  45.76 
 
 
199 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0094  rhodanese-like protein  53.75 
 
 
110 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  40.74 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  38.24 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1146  Rhodanese domain protein  43.56 
 
 
137 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0154905  hitchhiker  0.0000789559 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  41.05 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  40.38 
 
 
121 aa  78.2  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  39.22 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  48.68 
 
 
278 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2852  Rhodanese domain-containing protein  51.85 
 
 
113 aa  77.4  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 
102 aa  77  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  46 
 
 
194 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  39.22 
 
 
469 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1785  Rhodanese domain protein  45.78 
 
 
277 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  41.67 
 
 
123 aa  74.7  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0398  phage shock protein E, putative  32.35 
 
 
118 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  32.71 
 
 
123 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  43.37 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5022  rhodanese domain-containing protein  38.74 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.62 
 
 
383 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.43 
 
 
277 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  35.29 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2187  rhodanese-like protein  42.35 
 
 
135 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2630  Rhodanese domain protein  49.4 
 
 
112 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  36.89 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  36.63 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  36.63 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  44.58 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  36.63 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  33.01 
 
 
104 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  36.79 
 
 
116 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1869  rhodanese domain-containing protein  47.37 
 
 
117 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000584453  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3449  hypothetical protein  36.61 
 
 
170 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0310387  normal  0.0600537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  35.92 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  35 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0744  rhodanese domain-containing protein  41.84 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.547874 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  39.76 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.92 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1506  rhodanese-like domain-containing protein  42.67 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  36 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  36 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
121 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  42.99 
 
 
356 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0156  rhodanese domain-containing protein  51.16 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.634327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  38.82 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  41.18 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.71 
 
 
392 aa  70.9  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  40.57 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  40.57 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06435  rhodanese-like domain protein  36.36 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  42.86 
 
 
282 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3083  rhodanese-like protein  41.05 
 
 
198 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4502  rhodanese domain protein  35.35 
 
 
106 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000125485 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  42.06 
 
 
356 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3925  rhodanese-like protein  41.25 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
98 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.61 
 
 
460 aa  70.1  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3678  hypothetical protein  45.33 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.233085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  41.12 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0959  Rhodanese domain protein  45.33 
 
 
107 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1317  rhodanese-like domain-containing protein  34.88 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3148  putative phage shock protein E  37.25 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  36.27 
 
 
125 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  47.37 
 
 
820 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  36.46 
 
 
98 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.6 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.39 
 
 
390 aa  69.3  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  40.86 
 
 
711 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2247  rhodanese domain-containing protein  44 
 
 
107 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256006  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4512  rhodanese domain-containing protein  36.04 
 
 
111 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0750  rhodanese-like protein  42.5 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1041  Rhodanese domain protein  43.75 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  41.12 
 
 
356 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1056  putative rhodanese-related sulfurtransferase  41.33 
 
 
116 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.218606  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0911  rhodanese domain-containing protein  42.67 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.174972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>