More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2014 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  75.56 
 
 		 405 aa  671    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  79.21 
 
 		 406 aa  680    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2317  tryptophanyl-tRNA synthetase  73.92 
 
 		 400 aa  639    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 405 aa  840    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  76.54 
 
 		 404 aa  676    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.84 
 
 		 405 aa  633  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.35 
 
 		 404 aa  627  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.29 
 
 		 404 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.79 
 
 		 404 aa  622  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.22 
 
 		 400 aa  614  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.66 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.103287 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  72.41 
 
 		 400 aa  615  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0993  tryptophanyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 		 400 aa  605  9.999999999999999e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1686  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.95 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.35 
 
 		 400 aa  597  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 400 aa  594  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.1 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.93 
 
 		 400 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1525  tryptophanyl-tRNA synthetase  71.79 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0769059 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  68.35 
 
 		 400 aa  594  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000348346 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  591  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.68 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.59 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2007  tryptophanyl-tRNA synthetase  67.69 
 
 		 391 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.700621  hitchhiker  0.00000750166 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 404 aa  569  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0739  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.59 
 
 		 402 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1466  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1789  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.45 
 
 		 403 aa  508  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 329 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.7 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 		 328 aa  281  1e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 		 330 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0343  tryptophanyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 		 392 aa  279  6e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289554  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 328 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000535382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.73 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.39 
 
 		 323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.5 
 
 		 330 aa  272  7e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 329 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.64 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.71 
 
 		 391 aa  267  2.9999999999999995e-70  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.19 
 
 		 373 aa  263  6e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  38 
 
 		 331 aa  262  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.94 
 
 		 330 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.99 
 
 		 327 aa  259  9e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000268792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  63.53 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.21 
 
 		 342 aa  252  9.000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 356 aa  250  4e-65  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.69 
 
 		 356 aa  250  4e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.97 
 
 		 340 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 327 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.49 
 
 		 324 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 		 325 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  62.94 
 
 		 329 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  60 
 
 		 326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 332 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.41 
 
 		 328 aa  240  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.76 
 
 		 329 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 331 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.08 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.48 
 
 		 330 aa  237  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  36.66 
 
 		 340 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  35.34 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.12 
 
 		 329 aa  226  4e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  64.71 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  35.44 
 
 		 337 aa  220  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.71 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.43 
 
 		 326 aa  219  5e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.55 
 
 		 331 aa  211  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.67 
 
 		 331 aa  209  5e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000674679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4238  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.32 
 
 		 337 aa  203  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121944  hitchhiker  0.0000708237 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.5 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0070  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.41 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.229775  normal  0.611279 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7191  tryptophanyl-tRNA synthetase II  32.35 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 		 340 aa  193  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 354 aa  191  2e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  30 
 
 		 340 aa  191  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 348 aa  188  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1308  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.59 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.917887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  31.99 
 
 		 342 aa  185  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0177  tryptophanyl-tRNA synthetase  32.23 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.595175  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06541  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.43 
 
 		 338 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06241  tryptophanyl-tRNA synthetase  28.18 
 
 		 338 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.682409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>