93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0757 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  100 
 
 		 635 aa  1248    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0356  LppC putative lipoprotein  35.62 
 
 		 629 aa  318  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  37.96 
 
 		 631 aa  299  1e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4995  putative lipoprotein  36.15 
 
 		 604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.713572  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57480  putative lipoprotein  38.06 
 
 		 604 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  31.76 
 
 		 661 aa  259  7e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0911  LppC family lipoprotein  38.93 
 
 		 602 aa  254  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4684  LppC putative lipoprotein  34.67 
 
 		 603 aa  247  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  38 
 
 		 628 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4113  LppC putative lipoprotein  34.3 
 
 		 604 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  32.81 
 
 		 603 aa  227  6e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0933  LppC family lipoprotein  33.98 
 
 		 605 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  33.84 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  34.97 
 
 		 605 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  35 
 
 		 605 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  34.77 
 
 		 605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  34.09 
 
 		 617 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13140  LppC lipoprotein  35.84 
 
 		 607 aa  208  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2200  LppC putative lipoprotein  31.06 
 
 		 596 aa  203  8e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4419  lipoprotein, putative  31.24 
 
 		 604 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0598181  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0185  putative lipoprotein  32.54 
 
 		 625 aa  194  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0300  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 619 aa  194  4e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  34.08 
 
 		 394 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  34.08 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0352  LppC family lipoprotein  29.18 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.184471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4251  LppC family lipoprotein  28.53 
 
 		 626 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.945552  hitchhiker  0.0000000616017 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  30.37 
 
 		 616 aa  189  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  30.98 
 
 		 595 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  29.56 
 
 		 627 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  29.71 
 
 		 628 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3684  LppC family lipoprotein  29.33 
 
 		 627 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4099  LppC family lipoprotein  29.93 
 
 		 634 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4187  LppC family lipoprotein  29.93 
 
 		 634 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3989  LppC family lipoprotein  29.93 
 
 		 634 aa  180  9e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0676  LppC family lipoprotein  29.28 
 
 		 705 aa  178  3e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4069  LppC family lipoprotein  29.72 
 
 		 634 aa  177  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  29.28 
 
 		 607 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0252  LppC family lipoprotein  29.13 
 
 		 624 aa  168  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.625916  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2212  LppC family lipoprotein  29.96 
 
 		 621 aa  167  4e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.228557 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  29.78 
 
 		 555 aa  167  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0227  LppC family lipoprotein  28.02 
 
 		 634 aa  167  5e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.238094 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0273  LppC putative lipoprotein  29.38 
 
 		 603 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000539466  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2654  putative lipoprotein LppC  28.67 
 
 		 603 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  29.31 
 
 		 603 aa  160  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0113  putative lipoprotein  26.57 
 
 		 653 aa  157  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  26.42 
 
 		 617 aa  155  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  26.87 
 
 		 677 aa  147  4.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0590  LppC family lipoprotein  31.46 
 
 		 573 aa  145  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.990028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3624  LppC family lipoprotein  25.64 
 
 		 680 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04379  LppC superfamily  31.18 
 
 		 576 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.418769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2282  putative lipoprotein-like protein  28.3 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0539  LppC family lipoprotein  26.26 
 
 		 657 aa  133  9e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0475  putative LppC lipoprotein  26.26 
 
 		 689 aa  133  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1120  hypothetical protein  26.26 
 
 		 689 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4432  hypothetical protein  29.25 
 
 		 721 aa  129  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0308  LppC family lipoprotein  25.93 
 
 		 672 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0314  LppC family lipoprotein  30.21 
 
 		 672 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.92899  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3782  LppC family lipoprotein  31.3 
 
 		 682 aa  120  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0529967  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3693  LppC putative lipoprotein  24.2 
 
 		 658 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  26.25 
 
 		 666 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0740  LppC precursor  22.67 
 
 		 604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.164476  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1675  LppC family lipoprotein  28.07 
 
 		 576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1749  hypothetical protein  32.78 
 
 		 576 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4336  LppC family lipoprotein  25.49 
 
 		 674 aa  116  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.765962  normal  0.192423 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3584  LppC family lipoprotein  29.79 
 
 		 704 aa  114  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.129912 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3442  putative lipoprotein  28.4 
 
 		 678 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0551  LppC family lipoprotein  28.32 
 
 		 678 aa  111  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.551185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3339  putative lipoprotein  28.32 
 
 		 678 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03014  hypothetical protein  28.32 
 
 		 678 aa  110  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0558  LppC family lipoprotein  28.32 
 
 		 678 aa  110  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02965  hypothetical protein  28.32 
 
 		 678 aa  110  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4466  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 678 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3629  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 678 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3625  putative lipoprotein  28.11 
 
 		 678 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  24.45 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0316  Putative lipoprotein-like protein  24.36 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.915463  hitchhiker  0.000474295 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0143  lipoprotein, putative  24.36 
 
 		 612 aa  106  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3453  LppC superfamily  27.89 
 
 		 680 aa  105  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3522  LppC superfamily  27.6 
 
 		 680 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3559  LppC superfamily  27.89 
 
 		 680 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3619  LppC family protein  27.89 
 
 		 680 aa  105  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3451  LppC superfamily  27.89 
 
 		 680 aa  104  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0105  ABC-type transport systems, periplasmic component  26.94 
 
 		 627 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1763  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  25.28 
 
 		 677 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1037  extracellular ligand-binding receptor  27.48 
 
 		 643 aa  70.1  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000129321  unclonable  0.0000121148 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3300  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.64 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464162 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1484  hypothetical protein  22.41 
 
 		 481 aa  58.5  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3863  Extracellular ligand-binding receptor  26.74 
 
 		 651 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0863227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0470  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.92 
 
 		 391 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.10614 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2555  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  28.65 
 
 		 606 aa  49.7  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305617 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2085  extracellular ligand-binding receptor  26.23 
 
 		 356 aa  48.5  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.137371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1534  putative lipoprotein-like protein  22.98 
 
 		 402 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.75635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11763  isopentenyl-diphosphate delta-isomerase  31.68 
 
 		 203 aa  44.7  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00483885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>