24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1484 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1484  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  986    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2394  putative lipoprotein-like protein  24.5 
 
 		 617 aa  79.7  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.527391  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1694  putative lipoprotein-like  25 
 
 		 525 aa  70.5  0.00000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.97529  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1933  putative lipoprotein  22.79 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.814696  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0260  lipoprotein antigen  22.79 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2463  LppC family lipoprotein  21.39 
 
 		 617 aa  61.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.36704  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2102  LppC family lipoprotein  22.35 
 
 		 631 aa  59.7  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0757  LppC family lipoprotein  23.4 
 
 		 635 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1177  LppC family lipoprotein  22.08 
 
 		 677 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.055728 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3066  hypothetical protein  21.51 
 
 		 603 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2923  hypothetical protein  21.51 
 
 		 603 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4399  LppC family lipoprotein  22.4 
 
 		 605 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.204458 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3354  putative lipoprotein  22.61 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1325  LppC family lipoprotein  22 
 
 		 605 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.967741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3145  ATPase  22.76 
 
 		 661 aa  48.5  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4523  LppC family lipoprotein  22 
 
 		 605 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004501  LppC putative lipoprotein  25.11 
 
 		 555 aa  48.5  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000349106  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0389  LppC family lipoprotein  26.69 
 
 		 607 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.743997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3692  LppC family lipoprotein  21.28 
 
 		 616 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2204  LppC family lipoprotein  23.57 
 
 		 628 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.972417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00891  hypothetical protein  24.23 
 
 		 603 aa  44.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0261  LppC family lipoprotein  21.18 
 
 		 628 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03355  putative lipoprotein  19.63 
 
 		 666 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3880  LppC family lipoprotein  21.46 
 
 		 627 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0981735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>