49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0314 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0314  hypothetical protein  100 
 
 		 169 aa  352  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.600566  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3251  hypothetical protein  37.4 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0774405  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3419  hypothetical protein  38.46 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3452  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  34.34 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0858  hypothetical protein  44.16 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0604  cytochrome c, class I  36.78 
 
 		 124 aa  62  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.24563  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3779  hypothetical protein  34.51 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3043  cytochrome c, class I  39.76 
 
 		 114 aa  59.7  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.372249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2862  cytochrome c class I  37.36 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0146  cytochrome c class I  35.96 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0811  sulfur oxidation protein SoxX  29.21 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641747  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2860  hypothetical protein  32.52 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3450  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.97 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1523  hypothetical protein  36.19 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.547199 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3255  hypothetical protein  31.75 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4962  hypothetical protein  32.5 
 
 		 247 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.640591  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1948  hypothetical protein  28.46 
 
 		 484 aa  57.4  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6956  cytochrome c class I  36.27 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0327018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4373  hypothetical protein  31.36 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1922  sulfur oxidation protein SoxX  29.67 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0854  hypothetical protein  35.53 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00309034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7668  cytochrome c class I  34.31 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3125  hypothetical protein  34.62 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2626  hypothetical protein  31.45 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0917  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  32.94 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.613288  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 126 aa  55.1  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3453  hypothetical protein  34.62 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1671  hypothetical protein  32.69 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1595  hypothetical protein  32.69 
 
 		 210 aa  54.3  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2280  hypothetical protein  33.65 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3129  hypothetical protein  35.8 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0102671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2433  hypothetical protein  32.43 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0567  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  35.29 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000813905  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1033  hypothetical protein  28.28 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3676  cytochrome c, class I  28.74 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0260  monoheme cytochrome SoxX  31.76 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00749516  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0697  putative cytochrome C  31.76 
 
 		 97 aa  51.6  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0856  hypothetical protein  34.21 
 
 		 233 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.097776  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4257  hypothetical protein  26.8 
 
 		 256 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.629836  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0806  hypothetical protein  35.58 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0518  sulfur oxidation protein SoxX  29.52 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00404971  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.04 
 
 		 370 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0433  hypothetical protein  40.26 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3671  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  26.72 
 
 		 135 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0434  hypothetical protein  37.66 
 
 		 227 aa  45.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.04 
 
 		 367 aa  44.7  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1909  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  28.33 
 
 		 150 aa  44.3  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00277827  normal  0.155687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0066  putative cytochrome c, putative SoxX protein  29.25 
 
 		 147 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3717  monoheme cytochrome SoxX (sulfur oxidation)  29.91 
 
 		 144 aa  41.6  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000435088  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>