91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2967 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2967  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  335  9.999999999999999e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.09 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2776  hypothetical protein  35.54 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1416  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.034656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1448  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0047791  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0391  hypothetical protein  40.54 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7320  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 288 aa  61.2  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000252308  decreased coverage  0.00000000279842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4246  putative signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.226283  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1247  hypothetical protein  36.22 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0531  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0976  hypothetical protein  37.9 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4605  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2074  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  0.91426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4370  putative signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1352  hypothetical protein  36.21 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.935548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0238  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 295 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.112494 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.94 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7843  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.32 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1655  hypothetical protein  34.09 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2295  hypothetical protein  37.1 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147419  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0979  hypothetical protein  31.54 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2582  putative signal transduction histidine kinase  39.6 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0114014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  41.49 
 
 		 616 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.697266  normal  0.4865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0019  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1173  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.03 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1805  hypothetical protein  33.06 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2770  putative signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.416371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2536  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.2 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1650  putative signal transduction histidine kinase  40.2 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0223546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1945  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.34 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00291504  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5447  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.74 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.279977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0265  hypothetical protein  34.13 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.620382  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1873  putative signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3632  ATP-binding region ATPase domain protein  41.46 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8587  putative signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00197112  normal  0.613164 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0755  putative regulatory protein  32.63 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4499  ATP-binding region ATPase domain protein  38.61 
 
 		 365 aa  50.8  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000991404  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0586  signal transduction histidine kinase, LytS  39.77 
 
 		 123 aa  50.8  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0183303  hitchhiker  0.00998812 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 		 722 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.48 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.903724  normal  0.217215 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0892  hypothetical protein  36.15 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0429  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.84 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2480  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.29 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.252056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1968  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.63 
 
 		 216 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.075139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0704  hypothetical protein  43.86 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3058  hypothetical protein  32.74 
 
 		 134 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000540346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2541  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.29 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.7405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4163  putative PAS/PAC sensor protein  34.04 
 
 		 1039 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0226672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4080  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  40 
 
 		 738 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.32388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1542  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 		 355 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0477003  hitchhiker  0.00647646 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1003  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.33 
 
 		 549 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00204881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.03 
 
 		 142 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0493061  normal  0.177095 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5442  putative signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0014  putative signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3435  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.37 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0121254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0233  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.21 
 
 		 347 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.211721  hitchhiker  0.0066599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1297  hypothetical protein  34.55 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3499  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5037  putative signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 173 aa  44.3  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.476889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1327  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.58 
 
 		 211 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4051  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.53 
 
 		 281 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.932154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5315  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  36.52 
 
 		 750 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.315721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3148  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.53 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00947281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  31.2 
 
 		 817 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2086  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.66 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.019454  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1570  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.15 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.196284  normal  0.153025 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3612  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0417  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.233306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2892  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  36.17 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0396  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.456804  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5025  putative signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.239464  normal  0.0584008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.2 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1510  C4-dicarboxylate transport sensor protein dctB  34.95 
 
 		 322 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.220294  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1230  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  35.29 
 
 		 310 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0439907  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0408  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  35.48 
 
 		 713 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 643 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  35.29 
 
 		 643 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0082  C4-dicarboxylate transport sensor kinase  35.29 
 
 		 643 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0104  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 		 141 aa  42  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.141556  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0287  protein phosphatase 2C-like protein  30.17 
 
 		 743 aa  42  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.575817  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.09 
 
 		 143 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000415643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0346  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 		 122 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7300  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  31.97 
 
 		 573 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4515  hypothetical protein  38.89 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.91 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.535186 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0192  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.513716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0025  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 226 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07231  anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  35.9 
 
 		 131 aa  40.8  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.152597 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7294  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 		 161 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>