More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2468 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  100 
 
 
448 aa  899    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  66.93 
 
 
468 aa  487  1e-136  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  62.77 
 
 
440 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  59.04 
 
 
425 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  53.85 
 
 
392 aa  371  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  49.2 
 
 
388 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  45.21 
 
 
518 aa  252  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 
499 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  41.06 
 
 
565 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  39.91 
 
 
605 aa  208  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  38.03 
 
 
386 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 
386 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
386 aa  176  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  35.92 
 
 
380 aa  176  7e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  35.19 
 
 
386 aa  176  8e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  35.37 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  35.38 
 
 
360 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  34.84 
 
 
384 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  36.41 
 
 
387 aa  159  8e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 
361 aa  156  9e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 
455 aa  143  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  25.76 
 
 
353 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 
445 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 
370 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
353 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  25.07 
 
 
349 aa  99.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
348 aa  97.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  37.23 
 
 
414 aa  94.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0156  glycosyl transferase group 1  24.84 
 
 
359 aa  93.6  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22800  glycosyl transferase group 1  24.18 
 
 
359 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
476 aa  90.1  7e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  36.32 
 
 
370 aa  89.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3236  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 
374 aa  89  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0188616  hitchhiker  0.000126621 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.19 
 
 
385 aa  87.4  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
371 aa  87  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  25.92 
 
 
935 aa  87  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5490  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
402 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
413 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02000  glycosyltransferase  35.86 
 
 
452 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
377 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5510  glycosyl transferase group 1  35.58 
 
 
399 aa  84.7  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.264139  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 
440 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1247  glycosyl transferase, group 1  27.58 
 
 
391 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.174724  normal  0.678195 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 
417 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  38.8 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  29.44 
 
 
389 aa  80.1  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3232  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
464 aa  80.1  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0216694  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1200  glycosyl transferase group 1  37.1 
 
 
384 aa  79.7  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.979166 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0208  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.73 
 
 
500 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0602  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.51 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.655223  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0588  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  25.51 
 
 
496 aa  79.7  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.409757  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0431  glycosyl transferase group 1  21.23 
 
 
380 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.16111  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2548  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
380 aa  78.6  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.339834  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0193  glycosyl transferase, group 1  21.43 
 
 
364 aa  79  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 
377 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3184  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  30.11 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  27.62 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0587  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  26.09 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  33.52 
 
 
376 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0601  Poly(glycerol-phosphate) alpha-glucosyltransferase  26.09 
 
 
490 aa  78.2  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.86353  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.96 
 
 
366 aa  77.8  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.78 
 
 
387 aa  77.8  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.91 
 
 
394 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  27.17 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  36.26 
 
 
388 aa  77.4  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.84 
 
 
360 aa  77  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  30.62 
 
 
414 aa  77  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1764  putative glycosyl transferase  34.97 
 
 
398 aa  77  0.0000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0831707  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  30.33 
 
 
386 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 
415 aa  76.6  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0986  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
429 aa  77  0.0000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.32714  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2920  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
435 aa  76.6  0.0000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
382 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2514  glycosyl transferase group 1  34.66 
 
 
351 aa  76.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0260745  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  24.68 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6737  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
385 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.755749  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2335  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 
410 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.78 
 
 
408 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7628  Glycosyltransferase-like protein  32.02 
 
 
372 aa  75.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.294474  normal  0.180766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2666  group 1 glycosyl transferase  33.51 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.882197  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  35.62 
 
 
360 aa  76.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 
393 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5152  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.011173  decreased coverage  0.000105469 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1731  N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein  23.71 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.183221  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  27.81 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3637  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
756 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.871876  hitchhiker  0.00349398 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1382  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0731677  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0823  glycosyl transferase group 1  34.93 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2213  glycosyl transferase group 1  40.91 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28310  glycosyltransferase  27.48 
 
 
417 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0640064  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03650  glycosyltransferase  30.47 
 
 
413 aa  74.7  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.736839  normal  0.451667 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3861  putative glycosyltransferase  34.25 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.862741 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 
373 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0610  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
367 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>