More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1263 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1263  CBS  100 
 
 
425 aa  826    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  71.09 
 
 
421 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  67.62 
 
 
421 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  58.29 
 
 
438 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  55.98 
 
 
430 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  57.76 
 
 
425 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  57.76 
 
 
440 aa  392  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  50.59 
 
 
425 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  50.59 
 
 
425 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  50.59 
 
 
425 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  51.62 
 
 
423 aa  367  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  50.47 
 
 
423 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  44.27 
 
 
444 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  41.96 
 
 
421 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  43.33 
 
 
438 aa  272  8.000000000000001e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  42.93 
 
 
555 aa  272  1e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  39.3 
 
 
448 aa  267  2e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  41.23 
 
 
460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  41.18 
 
 
533 aa  266  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  41.94 
 
 
418 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  41.15 
 
 
434 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  40.98 
 
 
432 aa  259  6e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 
470 aa  253  6e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  40.49 
 
 
439 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  37.75 
 
 
431 aa  243  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  34.79 
 
 
447 aa  237  2e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  34.35 
 
 
431 aa  228  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
434 aa  224  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.72 
 
 
441 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  34.83 
 
 
431 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.56 
 
 
447 aa  216  8e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.8 
 
 
465 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.27 
 
 
432 aa  210  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  33.26 
 
 
432 aa  209  7e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  31.53 
 
 
445 aa  207  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.04 
 
 
442 aa  203  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  34.59 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  31.92 
 
 
446 aa  200  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
447 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  34.03 
 
 
436 aa  197  3e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.13 
 
 
437 aa  197  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  35.63 
 
 
466 aa  196  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.31 
 
 
430 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  32.55 
 
 
443 aa  194  3e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  34.62 
 
 
438 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
424 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  30.62 
 
 
447 aa  192  7e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
437 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.57 
 
 
446 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  32.87 
 
 
456 aa  189  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 
439 aa  189  9e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  32.2 
 
 
436 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
444 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  33.26 
 
 
441 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  33.18 
 
 
479 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  32.08 
 
 
434 aa  187  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 
444 aa  187  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  32.95 
 
 
456 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
424 aa  186  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.42 
 
 
442 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  32.2 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  32.24 
 
 
435 aa  184  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 
443 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  33.33 
 
 
443 aa  184  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  34.79 
 
 
425 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  34.5 
 
 
442 aa  183  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  28.5 
 
 
432 aa  183  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  33.33 
 
 
425 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  32.48 
 
 
431 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  32.71 
 
 
430 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  30.79 
 
 
439 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  29.72 
 
 
440 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  27.58 
 
 
449 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  30.79 
 
 
439 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  32.33 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  29.09 
 
 
429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  32.57 
 
 
439 aa  180  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  31.43 
 
 
443 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  33.64 
 
 
433 aa  180  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  33.01 
 
 
445 aa  180  4e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  31.43 
 
 
443 aa  180  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  32.55 
 
 
428 aa  180  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.7 
 
 
430 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 
444 aa  180  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
440 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0561  protein of unknown function DUF21  31.65 
 
 
498 aa  179  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453215  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 
443 aa  179  8e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  31.35 
 
 
443 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  31.57 
 
 
436 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  36.04 
 
 
436 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  36.04 
 
 
436 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  30.92 
 
 
430 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  34.03 
 
 
441 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  29.49 
 
 
445 aa  177  4e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.43 
 
 
445 aa  177  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  32.71 
 
 
439 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  33.96 
 
 
446 aa  176  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28.38 
 
 
451 aa  176  8e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>