36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0101 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0101  hypothetical protein  100 
 
 
260 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.667597  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1575  hypothetical protein  32.95 
 
 
308 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1524  hypothetical protein  36.56 
 
 
239 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00235221  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2268  hypothetical protein  36.33 
 
 
219 aa  112  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.050147  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1966  hypothetical protein  32.73 
 
 
237 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69738  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1051  hypothetical protein  32.41 
 
 
217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0112813  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4852  hypothetical protein  42.71 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.384065  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3221  hypothetical protein  39.27 
 
 
228 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0359488 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0903  hypothetical protein  31.94 
 
 
217 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1045  hypothetical protein  32.41 
 
 
217 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.03211e-20 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0866  hypothetical protein  32.56 
 
 
217 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0961  hypothetical protein  31.94 
 
 
217 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1131  hypothetical protein  31.48 
 
 
217 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0852  hypothetical protein  38.84 
 
 
260 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0263  Protein of unknown function DUF2306, membrane  39.41 
 
 
238 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.650888 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4274  hypothetical protein  35.48 
 
 
227 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3229  hypothetical protein  32.83 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.892596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0531  hypothetical protein  42.86 
 
 
228 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475766  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2732  hypothetical protein  36.57 
 
 
356 aa  88.6  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.000236049  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5958  hypothetical protein  33.5 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.24363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1051  hypothetical protein  33.86 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.539591  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3808  hypothetical protein  32.3 
 
 
226 aa  82  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.325005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1316  hypothetical protein  30.26 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4047  Protein of unknown function DUF2306, membrane  30.73 
 
 
212 aa  70.5  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1836  hypothetical protein  29.27 
 
 
165 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.376011  normal  0.0442919 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2472  hypothetical protein  31.64 
 
 
280 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2418  hypothetical protein  34.38 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0833  hypothetical protein  29.19 
 
 
221 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6517  hypothetical protein  32.8 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6704  hypothetical protein  30.36 
 
 
212 aa  59.3  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2277  hypothetical protein  32.52 
 
 
211 aa  55.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.691204  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0061  hypothetical protein  31.62 
 
 
220 aa  52.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1806  hypothetical protein  30.25 
 
 
275 aa  52.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0349217  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2320  hypothetical protein  30 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1063  putative integral membrane protein  29.85 
 
 
231 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2467  hypothetical protein  36.69 
 
 
273 aa  48.9  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128943  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>