245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0283 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  68.26 
 
 
189 aa  243  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  61.05 
 
 
185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  67.9 
 
 
187 aa  225  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  67.9 
 
 
208 aa  225  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  61.35 
 
 
185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1670  LemA family protein  62.05 
 
 
186 aa  205  4e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0320592  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1519  hypothetical protein  53.8 
 
 
201 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.268793 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  52.26 
 
 
202 aa  194  4.0000000000000005e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  47.89 
 
 
217 aa  184  6e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  50.83 
 
 
196 aa  179  2e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  48.37 
 
 
183 aa  175  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  47.92 
 
 
193 aa  175  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  49.18 
 
 
183 aa  175  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  46.39 
 
 
197 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  50.54 
 
 
186 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  48.91 
 
 
186 aa  171  9e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  52.98 
 
 
183 aa  170  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  46.49 
 
 
184 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  51.22 
 
 
184 aa  169  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  46.39 
 
 
197 aa  169  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  49.38 
 
 
180 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  45.3 
 
 
184 aa  167  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  49.7 
 
 
185 aa  167  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  46.7 
 
 
181 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  51.83 
 
 
189 aa  166  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  47.75 
 
 
183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  47.75 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  46.89 
 
 
196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  52.12 
 
 
249 aa  164  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0999  LemA family protein  52.73 
 
 
194 aa  164  9e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  46.81 
 
 
188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  48.21 
 
 
188 aa  162  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5307  LemA family protein  44.04 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271744  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3391  LemA family protein  48.85 
 
 
220 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.066637  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  46.45 
 
 
183 aa  161  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1695  LemA family protein  44.04 
 
 
207 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.392231  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6198  hypothetical protein  42.86 
 
 
218 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3482  LemA family protein  46.84 
 
 
201 aa  160  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.399994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1190  hypothetical protein  47.59 
 
 
201 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  42.78 
 
 
212 aa  159  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  47.27 
 
 
186 aa  159  2e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3370  LemA family protein  47.7 
 
 
224 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0508  LemA family protein  47.7 
 
 
224 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2046  LemA family protein  44.79 
 
 
220 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  47.53 
 
 
186 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3040  LemA family protein  47.7 
 
 
224 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2052  LemA family protein  47.7 
 
 
224 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0313  hypothetical protein  47.7 
 
 
226 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0326  hypothetical protein  47.7 
 
 
224 aa  159  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.458639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2232  LemA family protein  47.7 
 
 
224 aa  159  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2119  hypothetical protein  47.73 
 
 
197 aa  158  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4336  LemA family protein  42.86 
 
 
193 aa  158  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.54593 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2020  LemA family protein  45.23 
 
 
211 aa  158  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1721  hypothetical protein  42.29 
 
 
244 aa  157  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3714  hypothetical protein  46.35 
 
 
204 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.774184  normal  0.302719 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1902  hypothetical protein  43.46 
 
 
206 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.519616 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06990  hypothetical protein  49.14 
 
 
202 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0284  LemA family protein  48.28 
 
 
222 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0971623  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  46.02 
 
 
188 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3402  hypothetical protein  45.83 
 
 
203 aa  156  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2297  LemA family protein  46.11 
 
 
211 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0145217 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  45.16 
 
 
184 aa  155  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3956  hypothetical protein  46.88 
 
 
202 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.992492  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0640  hypothetical protein  48.57 
 
 
202 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1794  LemA family protein  45.83 
 
 
194 aa  155  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0347089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1982  LemA family protein  44.33 
 
 
211 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.400761 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  45.83 
 
 
194 aa  155  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  47.62 
 
 
188 aa  155  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  45.6 
 
 
183 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  45.78 
 
 
184 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  44.44 
 
 
208 aa  154  6e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04653  LemA family protein  42.56 
 
 
212 aa  154  6e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0176024  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  45.05 
 
 
183 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0658  LemA family protein  47.67 
 
 
206 aa  154  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.14267  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1477  LemA family protein  49.13 
 
 
194 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0409  LemA family protein  40.2 
 
 
210 aa  153  1e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00662835 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  45.03 
 
 
201 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  45.45 
 
 
201 aa  153  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0453  hypothetical protein  40.2 
 
 
210 aa  153  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0665  hypothetical protein  44.5 
 
 
200 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.510927  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  46.39 
 
 
189 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1333  hypothetical protein  45.31 
 
 
210 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.58782  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2626  hypothetical protein  44.33 
 
 
208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  43.98 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  44.89 
 
 
201 aa  151  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  43.39 
 
 
192 aa  151  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  46.3 
 
 
182 aa  151  4e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3874  LemA family protein  45.96 
 
 
211 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.14771 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2027  LemA family protein  42.27 
 
 
195 aa  151  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.90664  normal  0.597952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  42.93 
 
 
194 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4746  LemA family protein  43.94 
 
 
214 aa  151  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0585872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  47.4 
 
 
194 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1761  LemA family protein  47.43 
 
 
204 aa  151  7e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.105862  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  47.49 
 
 
199 aa  150  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6372  LemA family protein  46.03 
 
 
246 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00757602  normal  0.786314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1822  LemA family protein  45.93 
 
 
200 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.29832  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1221  LemA family protein  47.09 
 
 
211 aa  150  1e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  48.5 
 
 
192 aa  150  1e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6689  hypothetical protein  42.93 
 
 
203 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00582649  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>