192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0168 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0168  Holliday junction DNA helicase RuvA  100 
 
 
119 aa  237  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.762094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4681  Holliday junction DNA helicase RuvA  62.61 
 
 
207 aa  143  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2298  Holliday junction DNA helicase RuvA  60.75 
 
 
207 aa  137  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2820  Holliday junction DNA helicase RuvA  52.1 
 
 
213 aa  127  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.480869 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0018  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.76 
 
 
210 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0020  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.76 
 
 
210 aa  126  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2472  Holliday junction DNA helicase RuvA  53.39 
 
 
212 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.196184  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4475  Holliday junction DNA helicase RuvA  56.07 
 
 
209 aa  115  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15861  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.11 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1298  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.7 
 
 
214 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1161  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.04 
 
 
214 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.981458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1216  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.51 
 
 
205 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.210399  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4202  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.51 
 
 
205 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.173502  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1245  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.51 
 
 
205 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.738267  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4408  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
202 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0615399  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0414  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.85 
 
 
192 aa  60.5  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1583  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.34 
 
 
193 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.281985  normal  0.49857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1453  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.05 
 
 
187 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.112528  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3999  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.66 
 
 
205 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1879  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.45 
 
 
193 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000619466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1271  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.4 
 
 
202 aa  57  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0682991  normal  0.630495 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3978  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.36 
 
 
202 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0282687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36700  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.41 
 
 
204 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0419  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.51 
 
 
194 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0911  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.85 
 
 
189 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1409  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.36 
 
 
202 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.103613  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4062  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.9 
 
 
192 aa  55.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1416  Holliday junction DNA helicase RuvA  37.25 
 
 
220 aa  55.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.685038 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_384  Holliday junction DNA helicase  37.23 
 
 
194 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0442  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.19 
 
 
194 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1437  Holliday junction DNA helicase RuvA  41.84 
 
 
204 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000146819  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09371  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.53 
 
 
224 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0618985  normal  0.218033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2189  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.79 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000251944  normal  0.355786 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0268  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.47 
 
 
224 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.426034  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2204  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.45 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1915  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.45 
 
 
201 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51790  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.17 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000465402 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4542  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.17 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2134  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.11 
 
 
195 aa  52.8  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  hitchhiker  0.000118824 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2337  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.58 
 
 
197 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.194735  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0891  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.83 
 
 
195 aa  52.4  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0818688 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1333  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.82 
 
 
203 aa  52.8  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000329731  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0616  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.13 
 
 
196 aa  52.4  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.00649233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3831  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.2 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0993  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.21 
 
 
197 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.257053  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4725  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.51 
 
 
202 aa  51.6  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1424  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.74 
 
 
210 aa  52  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000192016  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3626  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.11 
 
 
198 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0674583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1251  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
199 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0857  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  26.4 
 
 
225 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0640033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2477  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.95 
 
 
194 aa  51.2  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.389677  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0062  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.75 
 
 
193 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23532  normal  0.677868 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0061  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.75 
 
 
193 aa  51.2  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2386  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.31 
 
 
200 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1754  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
200 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000623811  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2534  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  28.81 
 
 
207 aa  50.4  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416621  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0420  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.82 
 
 
200 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2353  Holliday junction DNA helicase RuvA  38.95 
 
 
194 aa  50.4  0.000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.547794 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0527  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.97 
 
 
199 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1248  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.33 
 
 
200 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2266  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.82 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1110  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.63 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1344  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  30.43 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.151452  normal  0.533304 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2313  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.82 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2305  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.82 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.765847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1115  Holliday junction DNA helicase RuvA  36.52 
 
 
197 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1847  Holliday junction DNA helicase subunit RuvA  29.55 
 
 
206 aa  48.9  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0445343  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2301  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.72 
 
 
197 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0709  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.19 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0528487  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02691  Holliday junction DNA helicase motor protein  30.39 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000921844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2720  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
197 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1705  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.93 
 
 
209 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.275173  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4502  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.65 
 
 
198 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0484  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.05 
 
 
193 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0684  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.25 
 
 
207 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.801169  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12613  Holliday junction DNA helicase RuvA  27.97 
 
 
196 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000939698  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2213  DNA recombination protein, RuvA  33.62 
 
 
191 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0140161 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0745  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.19 
 
 
199 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000883401  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3315  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.06 
 
 
199 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2430  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.78 
 
 
203 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0285195  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1112  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.26 
 
 
197 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.810212  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0313  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.04 
 
 
196 aa  47.4  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178792  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3189  Holliday junction DNA helicase RuvA  30.09 
 
 
200 aa  47.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00764376  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2235  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.52 
 
 
201 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0139  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.7 
 
 
199 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3674  Holliday junction DNA helicase RuvA  26.09 
 
 
205 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000325951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2671  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.33 
 
 
198 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.103257  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1076  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.9 
 
 
199 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131842  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0931  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.23 
 
 
199 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97537e-17 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0893  Holliday junction DNA helicase RuvA  34.04 
 
 
200 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000557116  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3177  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.47 
 
 
212 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0074  Holliday junction DNA helicase RuvA  33.02 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000176454  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1414  Holliday junction DNA helicase RuvA  29.17 
 
 
199 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000662939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0112  Holliday junction DNA helicase RuvA  35.9 
 
 
201 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1347  Holliday junction DNA helicase RuvA  28.44 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1226  Holliday junction DNA helicase RuvA  31.31 
 
 
190 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2421  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.73 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480934  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2031  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.73 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000338953  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2144  Holliday junction DNA helicase RuvA  32.73 
 
 
204 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0379489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>