279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4583 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4583  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  100 
 
 
221 aa  431  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3812  phosphoheptose isomerase  63.03 
 
 
225 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0616302  normal  0.0372991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08080  phosphoheptose isomerase  53.92 
 
 
224 aa  201  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3233  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  53.27 
 
 
223 aa  197  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2617  phosphoheptose isomerase  53.33 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.529886 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0862  phosphoheptose isomerase  45.28 
 
 
232 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.296003  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0714  phosphoheptose isomerase  45.28 
 
 
231 aa  166  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3209  phosphoheptose isomerase  43.69 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0473  phosphoheptose isomerase  45.2 
 
 
199 aa  151  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.114293 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2381  phosphoheptose isomerase  43.5 
 
 
197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3096  phosphoheptose isomerase  43.16 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286369  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0920  phosphoheptose isomerase  46.01 
 
 
189 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0298186  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2549  Phosphoheptose isomerase-like protein  45.67 
 
 
391 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0968114  normal  0.205112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2605  phosphoheptose isomerase  44.38 
 
 
188 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0978  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 
196 aa  126  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0530392  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2619  phosphoheptose isomerase  40.5 
 
 
280 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3592  phosphoheptose isomerase  45.51 
 
 
189 aa  125  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.020908  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1369  phosphoheptose isomerase  35.08 
 
 
197 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0131  phosphoheptose isomerase  44.69 
 
 
210 aa  124  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000153742  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1285  phosphoheptose isomerase  42.42 
 
 
210 aa  122  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.939986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3621  phosphoheptose isomerase  46.84 
 
 
193 aa  122  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1068  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
197 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.285178 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0573  phosphoheptose isomerase  37.82 
 
 
195 aa  122  6e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2087  phosphoheptose isomerase  42.27 
 
 
189 aa  121  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0314  rfaE bifunctional protein  45.73 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000289381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0141  phosphoheptose isomerase/cytidylyltransferase  45.73 
 
 
358 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1756  phosphoheptose isomerase  40 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1275  phosphoheptose isomerase  40.43 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2104  phosphoheptose isomerase  40.85 
 
 
198 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.375307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1296  phosphoheptose isomerase  46.79 
 
 
197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2295  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.715757  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3291  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
197 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3277  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3242  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544428  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2173  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0533  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.436359  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1067  phosphoheptose isomerase  43.59 
 
 
192 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0359  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 
192 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0344  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 
192 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573238  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0349  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 
192 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.477864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0351  phosphoheptose isomerase  37.7 
 
 
192 aa  118  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178027  hitchhiker  0.00118485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0298  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0250  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.851625  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0402  phosphoheptose isomerase  36.9 
 
 
186 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.575218  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0582  phosphoheptose isomerase  39.06 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.244141 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3686  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0259  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3882  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.118064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0414  phosphoheptose isomerase  39.43 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.113258  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3694  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.456591  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1712  phosphoheptose isomerase  41.28 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.15186e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0686  phosphoheptose isomerase  45.95 
 
 
203 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.111927  normal  0.369891 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00217  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4253  phosphoheptose isomerase  37.95 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00003184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3385  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0254  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3991  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0250  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3398  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0266  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00221  hypothetical protein  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  45.78 
 
 
672 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0340  phosphoheptose isomerase  39.1 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.648368 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3874  phosphoheptose isomerase  42.01 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4189  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1338  phosphoheptose isomerase  35.59 
 
 
194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0218  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4071  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4101  phosphoheptose isomerase  38.55 
 
 
197 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0350  phosphoheptose isomerase  37.95 
 
 
195 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0433035  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0234  phosphoheptose isomerase  38.22 
 
 
192 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.407926  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08100  phosphoheptose isomerase  41.32 
 
 
206 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1609  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5671  phosphoheptose isomerase  42.08 
 
 
198 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.1409 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2507  phosphoheptose isomerase  40.12 
 
 
192 aa  116  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.211977  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4312  phosphoheptose isomerase  42.17 
 
 
195 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1423  phosphoheptose isomerase  37.2 
 
 
201 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.831164  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3206  phosphoheptose isomerase  41.71 
 
 
204 aa  115  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0225  phosphoheptose isomerase  37.35 
 
 
197 aa  115  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0706313  normal  0.114772 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2354  phosphoheptose isomerase  42.5 
 
 
199 aa  115  6e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3170  phosphoheptose isomerase  35.79 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3320  phosphoheptose isomerase  35.79 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364582 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3308  phosphoheptose isomerase  35.79 
 
 
193 aa  115  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.765862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0579  phosphoheptose isomerase  38.46 
 
 
186 aa  114  7.999999999999999e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03359  phosphoheptose isomerase  39.16 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0950  phosphoheptose isomerase  35.79 
 
 
193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0245  phosphoheptose isomerase  39.39 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1285  phosphoheptose isomerase  37.82 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2311  phosphoheptose isomerase  41.88 
 
 
208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.720425  normal  0.582035 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1410  phosphoheptose isomerase  39.38 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3356  phosphoheptose isomerase  37.35 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1166  phosphoheptose isomerase  37.82 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.489496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4997  phosphoheptose isomerase  40.25 
 
 
197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.478077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0451  phosphoheptose isomerase  42.62 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.496053  normal  0.967141 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0406  phosphoheptose isomerase  43.42 
 
 
195 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0271  phosphoheptose isomerase  36.75 
 
 
196 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000156445  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3429  phosphoheptose isomerase  38.02 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3810  putative sedoheptulose 7-phosphate isomerase  42.68 
 
 
214 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.185071  normal  0.0383258 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0478  phosphoheptose isomerase  38.65 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2549  phosphoheptose isomerase  40.68 
 
 
226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000227289  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>