More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3227 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 312 aa  620  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  49.19 
 
 		 311 aa  298  8e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2343  periplasmic solute binding protein  52.4 
 
 		 312 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.04012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  50.89 
 
 		 315 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  52.63 
 
 		 311 aa  279  5e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  48.31 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  51 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  44.41 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  48.22 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  47.46 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.86 
 
 		 320 aa  246  4e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  40.66 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0522  periplasmic solute binding protein  39 
 
 		 349 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  44.74 
 
 		 308 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  47.27 
 
 		 311 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36810  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  46.37 
 
 		 288 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00286711  normal  0.394696 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3749  periplasmic solute binding protein  44.89 
 
 		 294 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  hitchhiker  0.00387824 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2168  periplasmic solute binding protein  43.41 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0250158  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1859  periplasmic solute binding protein  38.83 
 
 		 362 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0088  periplasmic solute binding protein  43.87 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  40.33 
 
 		 309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11830  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  41.03 
 
 		 339 aa  200  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00348761  normal  0.825122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  34.29 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  36.42 
 
 		 349 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  35.13 
 
 		 307 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  32.37 
 
 		 318 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  39.05 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.67 
 
 		 514 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  38.16 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  29.9 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  35.33 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  43.6 
 
 		 506 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  34.34 
 
 		 332 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.47 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  29.47 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  28.98 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  29.47 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  29.47 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  29.47 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  36.18 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.84 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  29.15 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  30.18 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  30.18 
 
 		 317 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  34.15 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  35.27 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  33.45 
 
 		 304 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0461  periplasmic solute binding protein  30.03 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 333 aa  155  7e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  31.51 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  32.4 
 
 		 333 aa  153  5e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  29.32 
 
 		 280 aa  149  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 		 339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  30.04 
 
 		 265 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  31.09 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000444188  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  29.04 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  27.3 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 		 301 aa  146  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  29.19 
 
 		 323 aa  143  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  29.54 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 333 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2383  ABC transporter, substrate-binding protein  27.33 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  28.3 
 
 		 298 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  34.74 
 
 		 346 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  31.23 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  28.16 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  32.18 
 
 		 353 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  34.39 
 
 		 303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  35.87 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  27.53 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 368 aa  125  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  33.12 
 
 		 292 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  26.62 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  32.51 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  32.98 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  30.63 
 
 		 344 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1015  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 285 aa  122  6e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1591  periplasmic solute binding protein  38.8 
 
 		 497 aa  122  8e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2081  adhesion lipoprotein, putative  25.4 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.24614  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  32.42 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 320 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0205  periplasmic solute binding protein  27.48 
 
 		 300 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.767408  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  26.67 
 
 		 322 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.39 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  25.39 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  30.16 
 
 		 294 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 282 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.32 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 		 317 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>