57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3120 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3120  membrane-bound metal-dependent hydrolase  100 
 
 
239 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163778  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2133  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.51 
 
 
238 aa  305  3e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.745599 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2176  membrane-bound metal-dependent hydrolase  68.09 
 
 
235 aa  305  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6744  hypothetical protein  41.05 
 
 
242 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.019291  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0967  putative integral membrane protein  41.23 
 
 
237 aa  148  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0630  membrane-bound metal-dependent hydrolase  37.72 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00076162  normal  0.281014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2277  membrane-bound metal-dependent hydrolase  40.93 
 
 
240 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0273545  normal  0.123352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8859  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.71 
 
 
240 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6479  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.12 
 
 
268 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5590  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.83 
 
 
242 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1445  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.41 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0192  membrane-bound metal-dependent hydrolase  34.78 
 
 
291 aa  88.6  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.353069  hitchhiker  0.00253224 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4226  membrane-bound metal-dependent hydrolase  31.1 
 
 
285 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3201  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.06 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0757158 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2977  membrane-bound metal-dependent hydrolase  32.2 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.48433  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5807  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.18 
 
 
277 aa  79  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.940742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34910  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  33.46 
 
 
254 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.199547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0212  membrane-bound metal-dependent hydrolase  36.91 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4172  membrane-bound metal-dependent hydrolase  30.73 
 
 
237 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17380  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  34.02 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.096354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0035  putative integral membrane protein  30.19 
 
 
236 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.995493  normal  0.0275677 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1299  membrane-bound metal-dependent hydrolase  27.66 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000344983 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1246  membrane-bound metal-dependent hydrolase  26.18 
 
 
274 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.482116  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22930  putative membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.49 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1914  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.11 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.109701  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1809  hypothetical protein  28.11 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1949  hypothetical protein  28.11 
 
 
196 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1973  hypothetical protein  28.11 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2203  hypothetical protein  23.21 
 
 
171 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00120723  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2241  hypothetical protein  23.21 
 
 
171 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136831  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01697  predicted inner membrane protein regulated by LexA  26.74 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.728151  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01685  hypothetical protein  26.74 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.540311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2446  hypothetical protein  26.74 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1904  hypothetical protein  26.74 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.727123 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1463  hypothetical protein  26.74 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1771  hypothetical protein  24.2 
 
 
169 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.380735  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1901  hypothetical protein  30.06 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0013  putative integral membrane protein  31.07 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.287986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06660  Predicted membrane-bound metal-dependent hydrolase (DUF457)  32.31 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1850  hypothetical protein  29.76 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00111152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0842  membrane-bound metal-dependent hydrolase  47.69 
 
 
163 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1435  hypothetical protein  29.76 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1450  hypothetical protein  27.98 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1418  hypothetical protein  29.76 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.597703  normal  0.0132689 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2023  hypothetical protein  29.76 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2194  hypothetical protein  28.9 
 
 
191 aa  52.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1715  hypothetical protein  27.03 
 
 
196 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.28693  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0932  membrane-bound metal-dependent hydrolase  41.51 
 
 
149 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1686  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0482652  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2650  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.141384  normal  0.0513814 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1796  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2124  hypothetical protein  34.69 
 
 
182 aa  45.8  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000163059  hitchhiker  0.000408284 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4186  membrane-bound metal-dependent hydrolase  28.1 
 
 
117 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.495485  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0844  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 
180 aa  42.7  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0828  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35 
 
 
224 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1129  membrane-bound metal-dependent hydrolase  24.79 
 
 
224 aa  42  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2446  membrane-bound metal-dependent hydrolase  39.24 
 
 
156 aa  41.6  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>